More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1647 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1647  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  47.26 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.569536 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3913  transcriptional regulator GadW  34.33 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4001  transcriptional regulator GadW  34.33 
 
 		 242 aa  141  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03363  DNA-binding transcriptional activator  33.91 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0198  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3717  transcriptional regulator GadW  33.91 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0202  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4875  transcriptional regulator GadW  33.91 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3818  transcriptional regulator GadW  33.48 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200734 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1164  putative envelope protein encoded within prophage CP-933N  46.88 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2194  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000326413  hitchhiker  0.0000000776188 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0052  HTH-type transcriptional regulator YdeO  30.47 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01457  predicted DNA-binding transcriptional acfivator  28.82 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01470  hypothetical protein  28.82 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1674  transcriptional regulator YdeO  28.82 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1689  transcriptional regulator YdeO  28.82 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1584  transcriptional regulator YdeO  28.82 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.249999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1762  transcriptional regulator YdeO  28.82 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2158  transcriptional regulator YdeO  28.82 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2112  transcriptional regulator YdeO  29.13 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.817957  normal  0.345974 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  49.51 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  49.51 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  49.51 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  49.51 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  49.51 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4641  porin thermoregulatory protein EnvY  31.82 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.841286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  44.44 
 
 		 309 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  44.44 
 
 		 309 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  44.44 
 
 		 309 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  44.44 
 
 		 309 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03987  DNA-binding transcriptional activator  30.29 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3876  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  43.43 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03948  hypothetical protein  30.29 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4550  porin thermoregulatory protein EnvY  32.6 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.578175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  41.58 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660589 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4613  transcriptional regulator AdiY  29.88 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5629  transcriptional regulator AdiY  29.88 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4356  transcriptional regulator AdiY  29.88 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3911  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4641  porin thermoregulatory protein EnvY  32.16 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4670  transcriptional regulator AdiY  29.88 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4581  transcriptional regulator AdiY  29.88 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03364  DNA-binding transcriptional dual regulator  40.59 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0197  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0201  DNA-binding transcriptional regulator GadX  40.59 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3719  DNA-binding transcriptional regulator GadX  40.59 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.842811  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03317  hypothetical protein  40.59 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3914  DNA-binding transcriptional regulator GadX  40.59 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4877  DNA-binding transcriptional regulator GadX  40.59 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4690  porin thermoregulatory protein EnvY  31.72 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4003  DNA-binding transcriptional regulator GadX  40.59 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0583  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3063  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00454347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0639  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.994132  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3086  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0579  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  34.23 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0092  transcriptional activator of virulence loci  34.15 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4884  hypothetical protein  33.61 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200087 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0031  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0066  AraC family transcription regulator  29.06 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0603708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  32 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3868  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0281  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  29.93 
 
 		 333 aa  62  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4147  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2406  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0741804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2365  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370263  hitchhiker  0.0000237936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0363  TCP pilus virulence regulatory protein  30.53 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.93807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>