More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1603 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  34.06 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  37.11 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  35.99 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  34.23 
 
 		 310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  37.37 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  35.82 
 
 		 313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  39.1 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  32.38 
 
 		 735 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  39.01 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  36.4 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  34.39 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  36.04 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  36.14 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  34.15 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.86 
 
 		 754 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.42 
 
 		 754 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  34.24 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.42 
 
 		 754 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.42 
 
 		 754 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.09 
 
 		 754 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.39 
 
 		 761 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.43 
 
 		 754 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  31.94 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.09 
 
 		 754 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.09 
 
 		 754 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.09 
 
 		 754 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.67 
 
 		 848 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.22 
 
 		 762 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  34.92 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  36.04 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.34 
 
 		 849 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.79 
 
 		 755 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  35.54 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  33.11 
 
 		 759 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  35.15 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  34.95 
 
 		 322 aa  158  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.38 
 
 		 995 aa  158  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  33.57 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  32.56 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.57 
 
 		 750 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  36.19 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  35.25 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  34 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  35.25 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  34.84 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  34.84 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  34.8 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  35.11 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  32.73 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  31.83 
 
 		 989 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.03 
 
 		 752 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  34.95 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  32.98 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  31.33 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  31.13 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  30.95 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  32.54 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  32.2 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  30.95 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  33.96 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  33.22 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  32.87 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  31.25 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  31.18 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.34 
 
 		 845 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  34.98 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  33.1 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  30.95 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  31.71 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  30.69 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.92 
 
 		 844 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  29.73 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  32.44 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  29.73 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  34.35 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  33.69 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  31.1 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  31.33 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  35.77 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  30.99 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  33.88 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  30.38 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  30.63 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  31.93 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  31.66 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  30.99 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  30.99 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  32.89 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  28.47 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  32.86 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  30.99 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  31.06 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.2 
 
 		 853 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  29.86 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  29.55 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>