More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0946 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 715 aa  1432    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  98.47 
 
 		 718 aa  1367    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 817 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 792 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 710 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 829 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 837 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 730 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 757 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 709 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 850 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  31.16 
 
 		 695 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 815 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 710 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 770 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 779 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 710 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 722 aa  227  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 709 aa  227  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 706 aa  226  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 706 aa  226  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 860 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 799 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 717 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 821 aa  220  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 717 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 698 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 864 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 700 aa  218  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 726 aa  217  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 701 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 701 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 726 aa  216  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 689 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  29.86 
 
 		 716 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 701 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 701 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 776 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 819 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 757 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 743 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 723 aa  214  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 791 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  28.57 
 
 		 791 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 757 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 748 aa  211  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 719 aa  211  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.8 
 
 		 703 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 828 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 701 aa  210  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.02 
 
 		 708 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 828 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  28.65 
 
 		 799 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 689 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 701 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1372  TonB-dependent receptor, plug  53.56 
 
 		 249 aa  207  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521856  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 829 aa  207  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 831 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 705 aa  206  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 692 aa  206  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 726 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 862 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 707 aa  206  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 778 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 767 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 703 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 859 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 711 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  30.11 
 
 		 680 aa  204  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 689 aa  204  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 751 aa  203  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 724 aa  203  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 717 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 797 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 708 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 738 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 734 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 828 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 719 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 796 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 825 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 743 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 825 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 721 aa  201  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 771 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 701 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.28 
 
 		 703 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 843 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 828 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  28.16 
 
 		 728 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 719 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 696 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 722 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  29.19 
 
 		 689 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 694 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 712 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 689 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 820 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 701 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>