More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3191 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 382 aa  775    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  43.83 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  45.53 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  43.73 
 
 		 409 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  45.05 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  44.78 
 
 		 377 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  43.68 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  42.2 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  41.18 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  39.92 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  38.06 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  38.06 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  37.72 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  41.38 
 
 		 296 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  33.51 
 
 		 442 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  32.44 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  29.86 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  31.64 
 
 		 392 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  31.22 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  31.22 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  33.33 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  32.88 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  30.58 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  30.95 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  29.89 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  34.27 
 
 		 418 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  36 
 
 		 408 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  30.69 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  33.16 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  30.14 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  28.3 
 
 		 385 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  31.31 
 
 		 381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  36.3 
 
 		 437 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  34.84 
 
 		 420 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  32.99 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  29.33 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  29.27 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  27.76 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  28.72 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  31.88 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  34.94 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  27.76 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  28.91 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  30.24 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  35.07 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  33.45 
 
 		 499 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  27.65 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  28.84 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  31.89 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  34.81 
 
 		 414 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  32.03 
 
 		 368 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  29.74 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  33.24 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  30.74 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  31.72 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  34.04 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  30.1 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  33.79 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  34.88 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  31.41 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  31.4 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  34.57 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  31.66 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  30.25 
 
 		 385 aa  129  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  29.93 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  29.89 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  30.68 
 
 		 381 aa  129  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  30.31 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  32.42 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  31.95 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  33 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  29.06 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  35.61 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  28.31 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  26.85 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  30.83 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  36.48 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  30.5 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  30.83 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  30.83 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  30.25 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  30.25 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  29.06 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  30.25 
 
 		 384 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  28.91 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  30.59 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  28.46 
 
 		 385 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  28.46 
 
 		 385 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  28.65 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  30.45 
 
 		 369 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  28.04 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1461  ribonuclease D  29.46 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  28.5 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  33.71 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  35.54 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  29.17 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3068  ribonuclease D  30.41 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  28.72 
 
 		 395 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  29.12 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  32.14 
 
 		 443 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>