More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0545 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  100 
 
 		 366 aa  753    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000873771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  47.37 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  46.65 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  43.77 
 
 		 333 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  42.2 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  47.24 
 
 		 378 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  44.13 
 
 		 357 aa  258  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  40.85 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  36.97 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  37.7 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  35.91 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  33.85 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  34.65 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  35.44 
 
 		 361 aa  189  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  33.16 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  33.16 
 
 		 378 aa  185  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  35.67 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  35.07 
 
 		 309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  33.71 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  34.37 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  35.49 
 
 		 306 aa  166  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  31.99 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0205  HflK protein  36.14 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  34.09 
 
 		 308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  34.23 
 
 		 407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  34.09 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  34.04 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  33.62 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  37.42 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  33.9 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  34.72 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  30.83 
 
 		 465 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  34.23 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  30.52 
 
 		 466 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  33.78 
 
 		 375 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  31.95 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  30.81 
 
 		 460 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  35.06 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  33.33 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  33.03 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  32.42 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  33.33 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  34.52 
 
 		 399 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  35.08 
 
 		 393 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  33.55 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  34 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  34.52 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  35.41 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  33.97 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  30.97 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  35.41 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  35.89 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  32.59 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  33.72 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  34.29 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  34.81 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  35.19 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  35.33 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  32.36 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  29.91 
 
 		 434 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  33.71 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  32.7 
 
 		 498 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  33.23 
 
 		 503 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  33.56 
 
 		 399 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  29.91 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  33.23 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  31.85 
 
 		 477 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  29.91 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  33.56 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  32.95 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  32.15 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  33.45 
 
 		 447 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  29.68 
 
 		 445 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1722  HflK protein  33.94 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1787  HflK protein  33.94 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  34.69 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  35.25 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  35.09 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  33.55 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  34.88 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3822  HflK protein  31.63 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0972078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  32.23 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  31.47 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  34.74 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  31.68 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  31.68 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  33.9 
 
 		 457 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  32.91 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  30.3 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  33.88 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  28.77 
 
 		 454 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  28.77 
 
 		 442 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.79 
 
 		 389 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  28.77 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  28.77 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  28.77 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  28.77 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  28.49 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  31.64 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  31.45 
 
 		 464 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>