More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0921 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  35.68 
 
 
170 aa  132  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  36 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  34.17 
 
 
163 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.5 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  36.1 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  35.78 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  36.1 
 
 
194 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  33.17 
 
 
206 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.2 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.99 
 
 
178 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.85 
 
 
166 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.85 
 
 
166 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  32.83 
 
 
221 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.25 
 
 
174 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.11 
 
 
184 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.79 
 
 
171 aa  98.2  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.88 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.59 
 
 
165 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  30.37 
 
 
174 aa  94  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.37 
 
 
184 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.3 
 
 
186 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.77 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.81 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.06 
 
 
278 aa  92.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.65 
 
 
188 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  29.33 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  29.5 
 
 
199 aa  91.3  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.51 
 
 
584 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.18 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.53 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.27 
 
 
174 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  26.63 
 
 
176 aa  89  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  28.57 
 
 
200 aa  89  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.65 
 
 
174 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  29.27 
 
 
261 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.27 
 
 
176 aa  87.8  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  28.12 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.12 
 
 
206 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  28.43 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  27.41 
 
 
244 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  26.18 
 
 
175 aa  85.1  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.51 
 
 
186 aa  84.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 
285 aa  84  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.7 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
244 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3233  nitroreductase  29.61 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.14 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  31.34 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  26.4 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  26.4 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  28.72 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  26.9 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  29.11 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  29.35 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  32.58 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.53 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  27.32 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.27 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  26.84 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.8 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.19 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.89 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  29.7 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.89 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  28.85 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.96 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  26.96 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  29 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.37 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  24.88 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  30.81 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.89 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.87 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  24.51 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.8 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.36 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.89 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.32 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  27.46 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.42 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  29.76 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  28.06 
 
 
243 aa  77.8  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.73 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.73 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  28.86 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.32 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.32 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.32 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.32 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.5 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.87 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  29.61 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  24.1 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  30.29 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  23.91 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>