117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1929 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1929  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0438098  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  43.31 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1072  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 116 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.81 
 
 		 326 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  33.08 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  35.96 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 324 aa  43.9  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  40.38 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0100  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  33.72 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 148 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.48 
 
 		 305 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 170 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 152 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 172 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 144 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 145 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 150 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 159 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 149 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 329 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  27.45 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>