More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0097 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  433  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  99.05 
 
 		 548 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  85.78 
 
 		 542 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  85.78 
 
 		 554 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  58.57 
 
 		 517 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  55.5 
 
 		 510 aa  235  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  57.69 
 
 		 563 aa  214  9e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  43.4 
 
 		 494 aa  155  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  43.06 
 
 		 506 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  37.2 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  35.94 
 
 		 551 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 579 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  35.64 
 
 		 540 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  37.44 
 
 		 496 aa  121  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  33.18 
 
 		 590 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  32.86 
 
 		 555 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 561 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  31.84 
 
 		 537 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  32.87 
 
 		 547 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  34.76 
 
 		 485 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  32.86 
 
 		 482 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  35.19 
 
 		 565 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  32.5 
 
 		 377 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  31.02 
 
 		 561 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  34.4 
 
 		 546 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 521 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  33.33 
 
 		 518 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.25 
 
 		 542 aa  92  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.25 
 
 		 542 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.25 
 
 		 542 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  32.35 
 
 		 558 aa  85.9  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  32.72 
 
 		 490 aa  82  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  36.14 
 
 		 493 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  31.71 
 
 		 502 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  36.07 
 
 		 743 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  30.19 
 
 		 515 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.91 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  31.31 
 
 		 522 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  30.66 
 
 		 520 aa  75.5  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.41 
 
 		 426 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.72 
 
 		 546 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  32.35 
 
 		 549 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  28.91 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  33.14 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  30.37 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  30 
 
 		 519 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.64 
 
 		 539 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  28.77 
 
 		 569 aa  72  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.54 
 
 		 613 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  31.38 
 
 		 641 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  28.65 
 
 		 550 aa  72  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.3 
 
 		 515 aa  72  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 		 555 aa  71.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  31.78 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  28.3 
 
 		 584 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  28.7 
 
 		 549 aa  68.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  29.3 
 
 		 597 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  30.3 
 
 		 525 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  31.1 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.83 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  32.3 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  31.48 
 
 		 531 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 		 576 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  31.68 
 
 		 539 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  30.67 
 
 		 505 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  29.63 
 
 		 606 aa  66.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  29.63 
 
 		 606 aa  66.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  30.73 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  27.01 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.64 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  27.14 
 
 		 554 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.94 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  32.08 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  30.72 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  30.72 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  30.72 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  30.72 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  27.61 
 
 		 342 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  29.07 
 
 		 537 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  28.44 
 
 		 662 aa  64.7  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  32.53 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  29.52 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  28.44 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  27.63 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  27.63 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  28.71 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  27.44 
 
 		 578 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  29.27 
 
 		 544 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  30.82 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  27.44 
 
 		 601 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  36 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2045  resolvase family site-specific recombinase  27.31 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2201  resolvase family site-specific recombinase  27.31 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  24.68 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  27.96 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  25.12 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1994  resolvase  28 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.854383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  28.25 
 
 		 598 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  25.12 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>