129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2907 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  100 
 
 		 439 aa  893    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  36.28 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  31.92 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  30.62 
 
 		 413 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  29.31 
 
 		 463 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  29.23 
 
 		 423 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  32.47 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  28.47 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  28.03 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  29.58 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  28.96 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  28.69 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  27.4 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  28.78 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  28.51 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  27.91 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  27.27 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  28.3 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  26.4 
 
 		 419 aa  128  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  27.29 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  26.15 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  28.83 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  35.68 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  34.13 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  26.94 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  33.66 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  26.73 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  25.85 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  32.16 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  29.52 
 
 		 423 aa  116  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  25.6 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  27.38 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  33.49 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  26.97 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  24.32 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  32.12 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  30.07 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  25.83 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  26.79 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  25.07 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  26.29 
 
 		 404 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  26.74 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  27.31 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  27.11 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  29.44 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  31.43 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  25.6 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  25.79 
 
 		 404 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  25.43 
 
 		 406 aa  97.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  32.64 
 
 		 403 aa  97.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  32.64 
 
 		 413 aa  96.7  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  25.53 
 
 		 407 aa  96.7  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  20.74 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  27.49 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  29.41 
 
 		 460 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  24.15 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  26.34 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  24.94 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  23.24 
 
 		 407 aa  90.5  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  25.68 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  35.43 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  26.17 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  26.13 
 
 		 406 aa  87.8  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  23.39 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  28.51 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  31.53 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  30.57 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  23.58 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  25.86 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  23.78 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  26.48 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  29.27 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  27.42 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  24.19 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  24.7 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  24.8 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  27.03 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  26.5 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  23.21 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  29.76 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  31.03 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  21.88 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  29.76 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  23.38 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  26.94 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  29.55 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  24.58 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  24.46 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  21.36 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  26.83 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  23.85 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  27.88 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  22.01 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  26.79 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  27.98 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 		 283 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>