More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3518 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 
299 aa  581  1e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  46.08 
 
 
305 aa  245  7e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.52 
 
 
403 aa  238  6e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  43.71 
 
 
304 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  41.06 
 
 
304 aa  233  2e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  44.33 
 
 
306 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  45.82 
 
 
313 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  1.89125e-05  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  50.34 
 
 
309 aa  231  8e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  47.33 
 
 
331 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  48.32 
 
 
310 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.43 
 
 
313 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  48.14 
 
 
405 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  48.14 
 
 
407 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  48.33 
 
 
327 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  46.73 
 
 
315 aa  226  5e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  42.33 
 
 
304 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  8.66742e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  43.63 
 
 
326 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  47.06 
 
 
400 aa  222  5e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.45 
 
 
403 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1628  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D protein  45.22 
 
 
358 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.08 
 
 
391 aa  221  1e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  41.78 
 
 
302 aa  221  1e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.39 
 
 
318 aa  220  2e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  44.73 
 
 
370 aa  220  2e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  44.73 
 
 
370 aa  220  2e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  47.06 
 
 
360 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  47.06 
 
 
402 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.75 
 
 
402 aa  219  4e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  47.06 
 
 
402 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  40.94 
 
 
306 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5026  RluA family pseudouridine synthase  46.18 
 
 
356 aa  218  8e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.257508  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  41.78 
 
 
302 aa  218  9e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  41.78 
 
 
302 aa  218  9e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.28194e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.71 
 
 
306 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  41.78 
 
 
302 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.69242e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1163  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.42 
 
 
334 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  40.6 
 
 
306 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.26 
 
 
305 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  42.81 
 
 
302 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  41.78 
 
 
302 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40417e-09 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  41.78 
 
 
302 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  45.63 
 
 
334 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1083  pseudouridine synthase, RluA family  46.42 
 
 
334 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0421612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.78 
 
 
302 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  7.62664e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.78 
 
 
302 aa  216  3e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.56 
 
 
395 aa  216  3e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.56 
 
 
395 aa  216  3e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  46.56 
 
 
389 aa  216  3e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  46.56 
 
 
395 aa  216  3e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  44.15 
 
 
318 aa  216  3e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  46.56 
 
 
389 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02131  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  38.78 
 
 
319 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  46.56 
 
 
389 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  46.56 
 
 
389 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10900  pseudouridine synthase, RluA family  45.71 
 
 
320 aa  216  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  unclonable  2.85325e-09 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.07 
 
 
303 aa  215  6e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  43.69 
 
 
302 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  41.44 
 
 
302 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2314  pseudouridine synthase, RluD  44.97 
 
 
334 aa  214  1e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.651442  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.95 
 
 
300 aa  214  1e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  4.47138e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1612  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.9 
 
 
356 aa  213  2e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.02 
 
 
308 aa  214  2e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  39.34 
 
 
306 aa  213  3e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.81 
 
 
300 aa  212  5e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.04845e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1482  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  51.8 
 
 
305 aa  212  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.696906  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  38.1 
 
 
319 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  42.76 
 
 
334 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67359e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  40.66 
 
 
306 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.72 
 
 
334 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  39.53 
 
 
305 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2615  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  45.24 
 
 
344 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0357699  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.25 
 
 
343 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.72 
 
 
347 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  46.73 
 
 
316 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0473  pseudouridine synthase, RluA family  42.59 
 
 
322 aa  208  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1865  RluA family pseudouridine synthase  43.92 
 
 
344 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.81 
 
 
321 aa  208  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  41.18 
 
 
302 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  45.17 
 
 
438 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0778  pseudouridine synthase, RluA family  38.98 
 
 
318 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0195  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  38.1 
 
 
319 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0799995  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  45.03 
 
 
431 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2003  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.92 
 
 
334 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.704766  normal  0.26865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  47.12 
 
 
436 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2950  RluA family pseudouridine synthase  42.11 
 
 
323 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118178  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  40.97 
 
 
305 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  40.97 
 
 
305 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  40.76 
 
 
324 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.59 
 
 
303 aa  206  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  43.87 
 
 
314 aa  205  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3499  lysozyme  41.1 
 
 
323 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  normal  0.0395097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3722  RluA family pseudouridine synthase  41.83 
 
 
323 aa  205  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.302376  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0345  RluA family pseudouridine synthase  42.26 
 
 
351 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  45.98 
 
 
345 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2550  pseudouridine synthase, RluD  44.19 
 
 
319 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.347335  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  44.12 
 
 
329 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  42.3 
 
 
320 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.67472e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0749  pseudouridine synthase, RluA family  39.09 
 
 
318 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.55 
 
 
318 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  46 
 
 
313 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>