78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2830 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  100 
 
 		 454 aa  920    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  61.54 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3960  secretion protein HlyD family protein  43.16 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06475  hypothetical protein  42.05 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00547225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  32.48 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2027  secretion protein HlyD  33.49 
 
 		 481 aa  189  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  28.26 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0279  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0284  hypothetical protein  36.67 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0283  membrane fusion protein  27.19 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.120506  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3788  multidrug resistance efflux pump-like protein  39.15 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0402  multidrug resistance efflux pump-like protein  39.78 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.24 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  24.77 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.07 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.06 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.77 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  23.94 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  24.19 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  19.3 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.93 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.81 
 
 		 448 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  23.7 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  21.35 
 
 		 387 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.64 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.88 
 
 		 674 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  24.56 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.19 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.49 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  21.72 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.65 
 
 		 432 aa  50.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  22.22 
 
 		 500 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.32 
 
 		 468 aa  50.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  21.58 
 
 		 461 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  22.25 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.11 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.3 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.3 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.26 
 
 		 389 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.24 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.47 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  20.05 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  20.05 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  22.85 
 
 		 467 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.73 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  22.36 
 
 		 498 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.29 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  21.2 
 
 		 627 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  24.29 
 
 		 396 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.07 
 
 		 460 aa  47  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.02 
 
 		 458 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.35 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.11 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.86 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.44 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.86 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.31 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.84 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  23.3 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  18.7 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  18.82 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.72 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.74 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  21.76 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.66 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.61 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  22.11 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  23.25 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.24 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.75 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  25.48 
 
 		 361 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  25.48 
 
 		 361 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  23.5 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.34 
 
 		 396 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  22.01 
 
 		 515 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  23.51 
 
 		 366 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>