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for query gene Cpin_2483 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2483  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 504 aa  1019    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.35671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.51 
 
 		 526 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.83 
 
 		 528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 		 524 aa  293  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 		 528 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.62 
 
 		 516 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.66 
 
 		 539 aa  211  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 		 537 aa  209  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 		 520 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.96 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.02 
 
 		 515 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.45 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.59 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 		 517 aa  183  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.18 
 
 		 517 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.88 
 
 		 532 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.53 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.42 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.46 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.21 
 
 		 529 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.06 
 
 		 503 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.06 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.12 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  24.77 
 
 		 561 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.77 
 
 		 511 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.4 
 
 		 529 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.21 
 
 		 536 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.85 
 
 		 517 aa  166  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.13 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.13 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.25 
 
 		 530 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  37.13 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.6 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 		 534 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.71 
 
 		 539 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  36.71 
 
 		 539 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  36.71 
 
 		 539 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  36.71 
 
 		 539 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.35 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 		 532 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 513 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.08 
 
 		 514 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 530 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  32.13 
 
 		 534 aa  160  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.68 
 
 		 514 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.95 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.23 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  22.74 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 		 511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  26.17 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 		 520 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  27.87 
 
 		 499 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 539 aa  156  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.59 
 
 		 526 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.64 
 
 		 526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1875  multidrug resistance protein B  32.47 
 
 		 360 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.23 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.23 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.45 
 
 		 535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.33 
 
 		 542 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.33 
 
 		 542 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.33 
 
 		 542 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 		 513 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.33 
 
 		 542 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.97 
 
 		 527 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.23 
 
 		 526 aa  153  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.13 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.436149 
 
 
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NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  27.23 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.97 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
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