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for query gene SO_0525 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  100 
 
 		 539 aa  1088    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  89.67 
 
 		 542 aa  959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  89.3 
 
 		 542 aa  956    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.16 
 
 		 526 aa  885    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.89 
 
 		 526 aa  874    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  89.3 
 
 		 542 aa  955    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  73.19 
 
 		 529 aa  746    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  89.67 
 
 		 542 aa  959    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.62 
 
 		 538 aa  844    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.38 
 
 		 535 aa  986    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.76 
 
 		 535 aa  988    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  81.09 
 
 		 543 aa  875    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  93.51 
 
 		 535 aa  994    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  58.46 
 
 		 534 aa  626  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.12 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.12 
 
 		 516 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.35 
 
 		 517 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.92 
 
 		 516 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  53.8 
 
 		 519 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.76 
 
 		 516 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  53.99 
 
 		 499 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.61 
 
 		 539 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.31 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.7 
 
 		 540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.32 
 
 		 519 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.56 
 
 		 536 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.83 
 
 		 529 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.58 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.2 
 
 		 523 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.81 
 
 		 527 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.86 
 
 		 527 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.15 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.61 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.54 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.54 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.96 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.17 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.48 
 
 		 536 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  38.26 
 
 		 528 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  40.2 
 
 		 508 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  36.1 
 
 		 524 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.34 
 
 		 532 aa  346  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.83 
 
 		 524 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  41.1 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
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NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.9 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.86 
 
 		 526 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.37 
 
 		 532 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.35 
 
 		 530 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  37.19 
 
 		 525 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 		 530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.66 
 
 		 528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.25 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.94 
 
 		 528 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.94 
 
 		 528 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.94 
 
 		 528 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 528 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.05 
 
 		 529 aa  326  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.74 
 
 		 525 aa  326  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.52 
 
 		 523 aa  325  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.66 
 
 		 524 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.61 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.77 
 
 		 529 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 		 528 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.55 
 
 		 524 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.58 
 
 		 529 aa  323  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 		 524 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.34 
 
 		 524 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 524 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 524 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.45 
 
 		 524 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.27 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  36.31 
 
 		 529 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.7 
 
 		 529 aa  320  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 		 528 aa  320  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 525 aa  319  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.12 
 
 		 525 aa  319  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 		 528 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.32 
 
 		 523 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.21 
 
 		 543 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 528 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.63 
 
 		 529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 		 525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.51 
 
 		 535 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.52 
 
 		 523 aa  312  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 516 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  37.8 
 
 		 511 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.65 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 526 aa  303  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.2 
 
 		 515 aa  302  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 506 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.34 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.76 
 
 		 516 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.59 
 
 		 515 aa  299  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 		 520 aa  293  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.5 
 
 		 515 aa  292  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 517 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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