More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2190 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
514 aa  1033    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  56.01 
 
 
495 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  53.85 
 
 
496 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.01 
 
 
517 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.01 
 
 
509 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  43.01 
 
 
509 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.77 
 
 
511 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  40.71 
 
 
561 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  40.53 
 
 
503 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.53 
 
 
510 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 
532 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.71 
 
 
512 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.55 
 
 
512 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  39.71 
 
 
534 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.51 
 
 
509 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  37.98 
 
 
526 aa  352  8.999999999999999e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.92 
 
 
512 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.32 
 
 
527 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.71 
 
 
493 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 
513 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.92 
 
 
527 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  37.58 
 
 
526 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 
526 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.89 
 
 
513 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.91 
 
 
511 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 
513 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 
508 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.98 
 
 
514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.98 
 
 
516 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.71 
 
 
508 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.53 
 
 
518 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 
511 aa  333  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.14 
 
 
507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.53 
 
 
520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.46 
 
 
514 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.29 
 
 
501 aa  322  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  37.76 
 
 
507 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.76 
 
 
507 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.25 
 
 
520 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.79 
 
 
515 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 
537 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 
520 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.89 
 
 
511 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 
532 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 
524 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 
515 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 
517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.65 
 
 
521 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.51 
 
 
529 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 
513 aa  302  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.74 
 
 
517 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 
512 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.67 
 
 
506 aa  294  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 
511 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.81 
 
 
513 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 
509 aa  289  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 
530 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 
526 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 
528 aa  277  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 
523 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.36 
 
 
526 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 
516 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 
529 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 
519 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 
512 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.58 
 
 
512 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 
539 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.78 
 
 
529 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 
530 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 
520 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 
530 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 
534 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 
529 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 
530 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 
530 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
537 aa  264  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.92 
 
 
534 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.1 
 
 
520 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 
511 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.98 
 
 
529 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 
528 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.3 
 
 
520 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 
511 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 
511 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 
520 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 
509 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 
520 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 
520 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.9 
 
 
505 aa  259  9e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 
511 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.15 
 
 
524 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.79 
 
 
529 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.6 
 
 
520 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 
520 aa  257  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 
527 aa  256  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.4 
 
 
520 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
500 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 
539 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  33.82 
 
 
509 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  30.27 
 
 
539 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>