More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0775 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 177 aa  362  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  68.94 
 
 		 171 aa  239  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  65.84 
 
 		 164 aa  225  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  63.16 
 
 		 171 aa  221  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  64.6 
 
 		 164 aa  220  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  61.11 
 
 		 170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  62.73 
 
 		 184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  41.73 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 193 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  41.1 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.52 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.52 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.52 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.52 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  42.52 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.52 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.52 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  34.01 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  32 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.73 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  33.1 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  34.74 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1423  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  38.24 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  37.86 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  35.64 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  35.92 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.64 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  35.64 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  35.64 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  35.64 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.64 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.64 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.64 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  38.2 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3170  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  37.23 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 137 aa  62  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>