More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0046 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0046  ABC transporter related protein  100 
 
 
306 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0867607  normal  0.238572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2072  ABC transporter related  46.01 
 
 
467 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2391  ABC transporter related  47.14 
 
 
470 aa  235  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  47.81 
 
 
486 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1344  ABC transporter related  48.19 
 
 
478 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3812  ABC transporter related  44.77 
 
 
462 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  42.96 
 
 
486 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2020  ABC transporter related  42.91 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.338544  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51970  ATP binding protein of ABC transporter  44.12 
 
 
465 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00174375  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  40.21 
 
 
516 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  36.93 
 
 
536 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  34.02 
 
 
547 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  34.93 
 
 
543 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  34.34 
 
 
552 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3807  ABC transporter related  33.33 
 
 
568 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  hitchhiker  0.00204057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  34.85 
 
 
569 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  35.31 
 
 
562 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  36.18 
 
 
547 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1611  ABC transporter related  37.64 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 
539 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  37.37 
 
 
550 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  31.51 
 
 
555 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  36.63 
 
 
532 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  35.88 
 
 
559 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  34.47 
 
 
563 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
534 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  33.22 
 
 
554 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  31.77 
 
 
556 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  31.16 
 
 
530 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  31.16 
 
 
530 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  33.44 
 
 
533 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.4 
 
 
665 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  33.66 
 
 
530 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  35.55 
 
 
559 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  35.55 
 
 
559 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  32.79 
 
 
566 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  31.37 
 
 
674 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  34.01 
 
 
542 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  30.64 
 
 
588 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  33.67 
 
 
544 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  35.56 
 
 
631 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  33.88 
 
 
555 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  32.89 
 
 
541 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  35.02 
 
 
531 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  33.22 
 
 
542 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  35.02 
 
 
539 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  30.87 
 
 
571 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  33.55 
 
 
555 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
627 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  33.55 
 
 
540 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  34.47 
 
 
534 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  31.05 
 
 
573 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  32.58 
 
 
540 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  32.58 
 
 
540 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  31.62 
 
 
549 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  30.89 
 
 
557 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  33.76 
 
 
562 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  32.58 
 
 
540 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  32.79 
 
 
582 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.29 
 
 
619 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  32.44 
 
 
537 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.9 
 
 
631 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  31 
 
 
557 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  32.13 
 
 
543 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  37.54 
 
 
532 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1949  ABC transporter related  35.79 
 
 
531 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.267995  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.54 
 
 
564 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  31.7 
 
 
542 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  30.74 
 
 
555 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  33.67 
 
 
597 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  34.47 
 
 
534 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  31.41 
 
 
544 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  32.98 
 
 
541 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  31.27 
 
 
609 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  29.97 
 
 
530 aa  125  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  32.07 
 
 
603 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  34.47 
 
 
543 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  32.77 
 
 
552 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  33.11 
 
 
540 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  32.2 
 
 
557 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  32.77 
 
 
544 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  33.11 
 
 
540 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  32.78 
 
 
540 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.79 
 
 
629 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  34.25 
 
 
542 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.43 
 
 
633 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  32.37 
 
 
556 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  34.47 
 
 
543 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  33.92 
 
 
532 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  31.66 
 
 
588 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  36.66 
 
 
594 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  31.69 
 
 
600 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  33 
 
 
555 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  33.9 
 
 
542 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  30.16 
 
 
543 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  30.79 
 
 
609 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  32.13 
 
 
563 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  33.44 
 
 
542 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  33.01 
 
 
549 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  31.4 
 
 
552 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>