More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4004 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 486 aa  924    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2072  ABC transporter related  61.9 
 
 		 467 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2391  ABC transporter related  49.68 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3812  ABC transporter related  49.24 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1344  ABC transporter related  52.05 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51970  ATP binding protein of ABC transporter  50.75 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00174375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2020  ABC transporter related  44.02 
 
 		 462 aa  340  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.338544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  42.89 
 
 		 486 aa  326  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  31.94 
 
 		 530 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  36.53 
 
 		 537 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  34.46 
 
 		 538 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  35.39 
 
 		 531 aa  243  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.53 
 
 		 536 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  32.75 
 
 		 534 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 		 536 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 		 536 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  34.23 
 
 		 533 aa  240  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  33.85 
 
 		 549 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  35.25 
 
 		 547 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0451  ATPase  38.17 
 
 		 552 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  33.4 
 
 		 557 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  35.91 
 
 		 530 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  36.82 
 
 		 556 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  35.21 
 
 		 537 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  35.8 
 
 		 544 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  33.08 
 
 		 529 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  32.66 
 
 		 535 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  34.61 
 
 		 563 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  31.45 
 
 		 543 aa  236  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  35.81 
 
 		 544 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  35.81 
 
 		 544 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  33.47 
 
 		 541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2413  glutathione import ATP-binding protein GsiA  33.08 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.137702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2368  glutathione import ATP-binding protein GsiA  33.08 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0121237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2570  glutathione import ATP-binding protein GsiA  33.08 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  38.97 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2456  glutathione import ATP-binding protein GsiA  33.27 
 
 		 529 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000644784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  32.06 
 
 		 525 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  34.53 
 
 		 543 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  34.39 
 
 		 537 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  36.4 
 
 		 551 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  34.92 
 
 		 542 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  35.51 
 
 		 549 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  34.69 
 
 		 527 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 551 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  33.33 
 
 		 524 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  34.53 
 
 		 543 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  37.2 
 
 		 548 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  36.95 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  32.93 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  36.8 
 
 		 551 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  33.07 
 
 		 543 aa  230  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  29.02 
 
 		 530 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  29.02 
 
 		 530 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  33.78 
 
 		 555 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.94 
 
 		 536 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 		 529 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  32.83 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  33.4 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 539 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  29.96 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  33.4 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 		 539 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  33.4 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  32.99 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  33.71 
 
 		 559 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 529 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 534 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  32.26 
 
 		 535 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.65 
 
 		 525 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  32.36 
 
 		 536 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  33.67 
 
 		 552 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  33.2 
 
 		 529 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 529 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  36.33 
 
 		 571 aa  228  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  34.43 
 
 		 539 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  34.43 
 
 		 539 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  32.01 
 
 		 534 aa  227  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  36.31 
 
 		 563 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  34.06 
 
 		 540 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  35.94 
 
 		 563 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  31.5 
 
 		 547 aa  226  7e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  32.46 
 
 		 536 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  32.67 
 
 		 539 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  33.27 
 
 		 533 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  34.53 
 
 		 530 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  32.5 
 
 		 557 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  34.19 
 
 		 564 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  37.67 
 
 		 551 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  32.99 
 
 		 531 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2225  ABC transporter related  35.49 
 
 		 532 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.691472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  33.33 
 
 		 542 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  35.27 
 
 		 557 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  32.64 
 
 		 542 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  35.29 
 
 		 545 aa  224  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  34.65 
 
 		 565 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.56 
 
 		 568 aa  224  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  32.29 
 
 		 536 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>