More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51970 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51970  ATP binding protein of ABC transporter  100 
 
 		 465 aa  904    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00174375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2020  ABC transporter related  53.12 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.338544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1344  ABC transporter related  57.82 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  49.89 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3812  ABC transporter related  49.79 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2391  ABC transporter related  48.3 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2072  ABC transporter related  47.84 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  50.75 
 
 		 486 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  33.87 
 
 		 543 aa  249  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 		 543 aa  246  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.39 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  34.44 
 
 		 557 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  35.13 
 
 		 540 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  35.13 
 
 		 540 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  35.92 
 
 		 549 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  34.93 
 
 		 540 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 539 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  36.44 
 
 		 531 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.82 
 
 		 596 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  35.92 
 
 		 588 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  36.44 
 
 		 559 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  33.65 
 
 		 615 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.86 
 
 		 536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  36.85 
 
 		 592 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  37.3 
 
 		 558 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  33.01 
 
 		 557 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  36.65 
 
 		 592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  34.86 
 
 		 543 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  37.85 
 
 		 585 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  35.45 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  35.45 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  35.55 
 
 		 537 aa  234  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  34.55 
 
 		 593 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  31.75 
 
 		 522 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  36.65 
 
 		 592 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 563 aa  233  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  36.23 
 
 		 559 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  36.23 
 
 		 559 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  35.76 
 
 		 552 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  34.4 
 
 		 549 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 539 aa  232  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  36.06 
 
 		 537 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  35.45 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  36.67 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  33.47 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  33.65 
 
 		 613 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  36.63 
 
 		 540 aa  230  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  35.6 
 
 		 555 aa  230  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  35 
 
 		 544 aa  229  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  33.47 
 
 		 571 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 530 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  34.49 
 
 		 566 aa  229  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  34.2 
 
 		 544 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  36.18 
 
 		 552 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  34.66 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  34.92 
 
 		 562 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  36.57 
 
 		 534 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 		 547 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.53 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  35.58 
 
 		 544 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.53 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  34.06 
 
 		 540 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  33.33 
 
 		 533 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.53 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.53 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  35.8 
 
 		 566 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  35.7 
 
 		 544 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.91 
 
 		 611 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 544 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 549 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  36 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  35.51 
 
 		 544 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  32.56 
 
 		 609 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.33 
 
 		 549 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  34.82 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  31.93 
 
 		 586 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  32.86 
 
 		 564 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  35.83 
 
 		 545 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  31.78 
 
 		 555 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  33.86 
 
 		 555 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  34 
 
 		 545 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  34.64 
 
 		 531 aa  223  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.06 
 
 		 617 aa  222  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  32.95 
 
 		 612 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  35.8 
 
 		 527 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  35.43 
 
 		 545 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  31.74 
 
 		 611 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  32.94 
 
 		 542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  34.51 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  33.87 
 
 		 532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  32.41 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  34.99 
 
 		 554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 		 559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  33.27 
 
 		 568 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 527 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  34.85 
 
 		 527 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  33.13 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  31.41 
 
 		 597 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  36.44 
 
 		 557 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>