More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3812 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3812  ABC transporter related  100 
 
 		 462 aa  906    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1344  ABC transporter related  50.97 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51970  ATP binding protein of ABC transporter  49.57 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00174375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2391  ABC transporter related  46.65 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2072  ABC transporter related  47.01 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2020  ABC transporter related  44.85 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.338544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  49.24 
 
 		 486 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 486 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  37.3 
 
 		 531 aa  253  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  38.32 
 
 		 555 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  38 
 
 		 554 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  39.92 
 
 		 540 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  38 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 536 aa  243  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 544 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  36.69 
 
 		 544 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 539 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 536 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  38.26 
 
 		 532 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  36.96 
 
 		 545 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  38.76 
 
 		 534 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  35.07 
 
 		 542 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  37.18 
 
 		 558 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  36.03 
 
 		 544 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  35.21 
 
 		 552 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  36.52 
 
 		 544 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  38.78 
 
 		 534 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  38.27 
 
 		 552 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  37.72 
 
 		 557 aa  236  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  37.65 
 
 		 552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  36.09 
 
 		 543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  36.34 
 
 		 536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  33.12 
 
 		 534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  37.76 
 
 		 547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  38.41 
 
 		 545 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  35.98 
 
 		 532 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  36.51 
 
 		 588 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  37.13 
 
 		 542 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  35.27 
 
 		 544 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  33.87 
 
 		 531 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  34.39 
 
 		 546 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  36.45 
 
 		 544 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  36.12 
 
 		 565 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 541 aa  232  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  34.56 
 
 		 539 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  36.01 
 
 		 549 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  34.21 
 
 		 588 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  36.55 
 
 		 545 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  35.92 
 
 		 561 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  35.26 
 
 		 542 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  33.2 
 
 		 571 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  35.77 
 
 		 543 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  37.47 
 
 		 547 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  34.36 
 
 		 539 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  34.23 
 
 		 533 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  35.26 
 
 		 550 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5346  ABC transporter related  38.06 
 
 		 536 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173896  normal  0.0532745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  36.18 
 
 		 560 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  38.1 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  33.13 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  34.18 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  37.16 
 
 		 518 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0451  ATPase  36.38 
 
 		 552 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  36.6 
 
 		 539 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  37.9 
 
 		 550 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  35.11 
 
 		 542 aa  227  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  34.93 
 
 		 542 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  35.66 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  34.91 
 
 		 542 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  33.73 
 
 		 553 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 540 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  34.9 
 
 		 546 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  36.74 
 
 		 551 aa  226  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 539 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  34.57 
 
 		 593 aa  226  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  38.08 
 
 		 534 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  38.71 
 
 		 549 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  34.74 
 
 		 549 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  33.47 
 
 		 525 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  34.4 
 
 		 538 aa  225  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  34.84 
 
 		 540 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 544 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 543 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  33.67 
 
 		 573 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  35.98 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  34.19 
 
 		 594 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 573 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  36.18 
 
 		 557 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  35.51 
 
 		 565 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  32.71 
 
 		 555 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  35.69 
 
 		 541 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  34.52 
 
 		 543 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  34 
 
 		 530 aa  223  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.81 
 
 		 536 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  35.91 
 
 		 569 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  32.7 
 
 		 611 aa  222  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  34.86 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>