More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1344 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1344  ABC transporter related  100 
 
 		 478 aa  925    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51970  ATP binding protein of ABC transporter  57.82 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00174375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2020  ABC transporter related  52.36 
 
 		 462 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.338544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3812  ABC transporter related  50.97 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  50.11 
 
 		 486 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2391  ABC transporter related  49.44 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2072  ABC transporter related  50.11 
 
 		 467 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  38.88 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  33.27 
 
 		 539 aa  243  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  38.41 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  33.6 
 
 		 543 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  35.16 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  34.99 
 
 		 531 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0046  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 306 aa  236  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0867607  normal  0.238572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  37.72 
 
 		 548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  36.63 
 
 		 562 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  35.67 
 
 		 545 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  33.54 
 
 		 571 aa  233  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  32.02 
 
 		 543 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  37.73 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  34.58 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  33.68 
 
 		 542 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  36.78 
 
 		 542 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  33.89 
 
 		 564 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 539 aa  226  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  32.79 
 
 		 542 aa  226  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  33.13 
 
 		 543 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  34.25 
 
 		 529 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  33.73 
 
 		 566 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  32.79 
 
 		 550 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  35.76 
 
 		 539 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  36.29 
 
 		 559 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  33.96 
 
 		 530 aa  226  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  33.47 
 
 		 555 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  36.36 
 
 		 552 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.31 
 
 		 548 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  33.13 
 
 		 543 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  34.16 
 
 		 533 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0451  ATPase  36.49 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  35.34 
 
 		 536 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  36.29 
 
 		 559 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  36.29 
 
 		 559 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  34.32 
 
 		 563 aa  223  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  33.27 
 
 		 555 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  35.34 
 
 		 571 aa  223  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  36.25 
 
 		 542 aa  223  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  32.94 
 
 		 539 aa  222  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  30.78 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 582 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2570  glutathione import ATP-binding protein GsiA  33.99 
 
 		 529 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182676 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  34.62 
 
 		 544 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.47 
 
 		 568 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2456  glutathione import ATP-binding protein GsiA  33.99 
 
 		 529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000644784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2413  glutathione import ATP-binding protein GsiA  33.8 
 
 		 529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.137702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2368  glutathione import ATP-binding protein GsiA  33.8 
 
 		 529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0121237  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  32.49 
 
 		 533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.71 
 
 		 536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  37.1 
 
 		 532 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  34.55 
 
 		 588 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  34.52 
 
 		 540 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  36.06 
 
 		 542 aa  221  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  32.15 
 
 		 537 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  31.96 
 
 		 576 aa  220  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.29 
 
 		 620 aa  220  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  33.59 
 
 		 536 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  34.9 
 
 		 545 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.9 
 
 		 524 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  34.23 
 
 		 592 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  31.63 
 
 		 549 aa  219  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  34.89 
 
 		 548 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  34.43 
 
 		 592 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  34.16 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  30.68 
 
 		 531 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  33.79 
 
 		 563 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  33.2 
 
 		 542 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  31.79 
 
 		 577 aa  219  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  35.54 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  32.66 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  31.89 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  34.23 
 
 		 592 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3807  ABC transporter related  34.56 
 
 		 568 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  hitchhiker  0.00204057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  31.16 
 
 		 624 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  35.5 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  33.79 
 
 		 544 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3157  ABC transporter for oligopeptide ATP-binding protein  33 
 
 		 587 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  35.17 
 
 		 547 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  31.66 
 
 		 567 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1494  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 530 aa  217  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.475677  normal  0.971253 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 		 530 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  35.21 
 
 		 552 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  33.73 
 
 		 542 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  33.67 
 
 		 544 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2714  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 530 aa  217  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  33.13 
 
 		 555 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2789  ABC transporter related  34.8 
 
 		 530 aa  217  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  33.47 
 
 		 530 aa  217  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  29.63 
 
 		 578 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>