More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2072 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2072  ABC transporter related  100 
 
 		 467 aa  918    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  61.9 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2391  ABC transporter related  50.33 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1344  ABC transporter related  50.11 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3812  ABC transporter related  47.67 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51970  ATP binding protein of ABC transporter  47.84 
 
 		 465 aa  360  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00174375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2020  ABC transporter related  42.79 
 
 		 462 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.338544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  31.37 
 
 		 530 aa  243  7e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  35.91 
 
 		 562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  33.4 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  31.62 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.88 
 
 		 536 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0046  ABC transporter related protein  46.01 
 
 		 306 aa  236  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0867607  normal  0.238572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.85 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 539 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  33.2 
 
 		 557 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  34.82 
 
 		 549 aa  233  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  34.21 
 
 		 582 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  35.88 
 
 		 551 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  34.92 
 
 		 555 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 516 aa  230  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.47 
 
 		 590 aa  230  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  35.38 
 
 		 565 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  35.67 
 
 		 551 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  33.2 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  36.4 
 
 		 545 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  32.52 
 
 		 524 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  33.4 
 
 		 557 aa  226  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  34.42 
 
 		 559 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  34.42 
 
 		 559 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  34.42 
 
 		 559 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  35.5 
 
 		 547 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  32.67 
 
 		 533 aa  225  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  33.27 
 
 		 559 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.48 
 
 		 548 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  31.01 
 
 		 527 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  31.19 
 
 		 547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  30.06 
 
 		 543 aa  223  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  31.4 
 
 		 535 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  33.33 
 
 		 544 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  35.7 
 
 		 547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.04 
 
 		 534 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 518 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  33.47 
 
 		 565 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  31.58 
 
 		 530 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  31.84 
 
 		 541 aa  221  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 		 551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  34.14 
 
 		 563 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  31.75 
 
 		 527 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  30.39 
 
 		 537 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  32.99 
 
 		 544 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  32.99 
 
 		 544 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  29.86 
 
 		 543 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  32.12 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  31.97 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  31.83 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  31.03 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  31 
 
 		 555 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 		 527 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  32.45 
 
 		 562 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  33.79 
 
 		 573 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  32.38 
 
 		 547 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  34.59 
 
 		 532 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  35.11 
 
 		 545 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  33.2 
 
 		 563 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  34.1 
 
 		 597 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  32.58 
 
 		 544 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  31.82 
 
 		 542 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  34.34 
 
 		 534 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  33.81 
 
 		 556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  33.55 
 
 		 539 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 		 543 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  30.91 
 
 		 536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 		 536 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  33.13 
 
 		 546 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  33.26 
 
 		 530 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  33.4 
 
 		 544 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  32.98 
 
 		 536 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  35.71 
 
 		 545 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  33.47 
 
 		 539 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  33.13 
 
 		 545 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 536 aa  213  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  33.13 
 
 		 549 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  30.04 
 
 		 538 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  34.81 
 
 		 534 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  35.22 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  29.36 
 
 		 530 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  29.36 
 
 		 530 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  33.81 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  30.64 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  33.62 
 
 		 539 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  31.13 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  32.9 
 
 		 543 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 		 572 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  33.62 
 
 		 539 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  32.3 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  30.64 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  31.76 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>