More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00100 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  52 
 
 		 599 aa  642    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  82.06 
 
 		 603 aa  1039    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  100 
 
 		 604 aa  1231    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  53.6 
 
 		 601 aa  649    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  82.39 
 
 		 603 aa  1032    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0016  GTP-binding protein TypA  65.95 
 
 		 612 aa  835    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000119023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  53.54 
 
 		 598 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 		 604 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 		 598 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 		 604 aa  628  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 		 604 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  52.09 
 
 		 602 aa  625  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 		 599 aa  626  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 		 614 aa  623  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  51.66 
 
 		 602 aa  621  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  51.66 
 
 		 602 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 602 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 598 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 600 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 		 601 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 603 aa  619  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 		 601 aa  618  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 602 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  50.91 
 
 		 602 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 599 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 610 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  50.83 
 
 		 600 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  51.01 
 
 		 610 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 602 aa  611  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 599 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  51 
 
 		 600 aa  610  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 		 610 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 605 aa  609  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  51.16 
 
 		 602 aa  611  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 		 601 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 		 606 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  51.07 
 
 		 611 aa  605  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 610 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 615 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  50.58 
 
 		 608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 613 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  49.07 
 
 		 592 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 		 605 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  49 
 
 		 608 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  49.42 
 
 		 608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 614 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  49.84 
 
 		 608 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  600  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 603 aa  601  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 608 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 		 602 aa  598  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  50.85 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 616 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 		 615 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 		 615 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 608 aa  595  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 607 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 		 608 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 627 aa  597  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  49.49 
 
 		 613 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  50.84 
 
 		 593 aa  595  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 		 608 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  48.11 
 
 		 618 aa  595  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 608 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1470  GTP-binding protein TypA  49.1 
 
 		 607 aa  592  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  47.23 
 
 		 612 aa  594  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 608 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 607 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 		 607 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  49.42 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  47.69 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  50.83 
 
 		 608 aa  588  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  48.18 
 
 		 615 aa  588  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  47.61 
 
 		 614 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  48.26 
 
 		 613 aa  588  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  47.61 
 
 		 614 aa  585  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  47.61 
 
 		 614 aa  585  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 613 aa  588  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 606 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  47.61 
 
 		 614 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 614 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1215  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 		 608 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378082  normal  0.59958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  47.45 
 
 		 614 aa  585  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>