61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2930 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  100 
 
 		 415 aa  855    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  34.26 
 
 		 567 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  34.26 
 
 		 567 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 429 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  30.29 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  30.8 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  28.44 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  29.07 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  30.56 
 
 		 522 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  28.45 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  27.64 
 
 		 419 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  28.34 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  27.93 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  27.11 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  25.98 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  27.04 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  28.48 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  30.03 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  29.23 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  26.4 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  24.49 
 
 		 405 aa  99  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  26.52 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  23.72 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  23.47 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  24.72 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  22.68 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  24.15 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  28.06 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  25.75 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  19.06 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2071  hypothetical protein  20.32 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  23.02 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  23.26 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  21.75 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  23.39 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  20.71 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  25.1 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.78 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  20.57 
 
 		 440 aa  53.1  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  23.51 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  22.02 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2302  hypothetical protein  20 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000101435  decreased coverage  0.00084282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 390 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 540 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 550 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.93 
 
 		 409 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  22.78 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  21.82 
 
 		 333 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  26.57 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>