More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3743 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3743  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 724 aa  1401    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.05 
 
 		 687 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  49.75 
 
 		 900 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.22 
 
 		 1009 aa  333  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.74 
 
 		 984 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.74 
 
 		 873 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.12 
 
 		 1596 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.24 
 
 		 1350 aa  317  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.74 
 
 		 903 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.43 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  48.26 
 
 		 1125 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.81 
 
 		 910 aa  308  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.92 
 
 		 1158 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 		 524 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.75 
 
 		 1125 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.89 
 
 		 973 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.35 
 
 		 1362 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.48 
 
 		 1157 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  41.94 
 
 		 968 aa  303  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.17 
 
 		 1124 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.96 
 
 		 1120 aa  302  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 969 aa  297  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  48.64 
 
 		 737 aa  296  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 		 846 aa  294  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.97 
 
 		 832 aa  289  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.91 
 
 		 864 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 		 880 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 		 873 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 		 1135 aa  285  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 		 860 aa  283  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 		 866 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 		 865 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 		 879 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1066 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 1407 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.07 
 
 		 903 aa  281  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.6 
 
 		 863 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 		 850 aa  281  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  42.54 
 
 		 1560 aa  280  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.76 
 
 		 877 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  44.74 
 
 		 786 aa  276  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.41 
 
 		 777 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 781 aa  274  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 876 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.38 
 
 		 582 aa  273  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 822 aa  273  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  41.67 
 
 		 1023 aa  272  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  43.68 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 		 817 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0811  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 		 661 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.82 
 
 		 655 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  39.95 
 
 		 661 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.25 
 
 		 1110 aa  269  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  41.27 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 		 772 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 		 982 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 932 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 		 882 aa  268  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 		 710 aa  267  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  40.66 
 
 		 764 aa  267  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 606 aa  267  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 		 896 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 		 750 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 		 911 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 		 803 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  39.8 
 
 		 784 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  40.88 
 
 		 1028 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.63 
 
 		 1068 aa  265  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 1433 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 		 859 aa  264  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.43 
 
 		 765 aa  264  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 		 895 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  42.16 
 
 		 955 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  41.92 
 
 		 666 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 		 951 aa  263  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 1195 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.2 
 
 		 738 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 		 873 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 827 aa  262  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 762 aa  262  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 		 1121 aa  261  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 		 750 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 		 923 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  41.78 
 
 		 982 aa  260  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 		 1064 aa  259  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  40.71 
 
 		 794 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 874 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  42.19 
 
 		 751 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 		 1302 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 1027 aa  259  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.26 
 
 		 901 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.08 
 
 		 785 aa  259  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 		 1059 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 1120 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 		 645 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 902 aa  258  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 695 aa  258  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 		 870 aa  258  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  45.01 
 
 		 698 aa  257  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  38.11 
 
 		 736 aa  257  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>