125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0970 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 991 aa  2023    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  40.61 
 
 		 1066 aa  661    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 1066 aa  566  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  34.09 
 
 		 972 aa  525  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 993 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  30.02 
 
 		 1007 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1007 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  29.37 
 
 		 1001 aa  355  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  28.68 
 
 		 994 aa  330  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1007 aa  323  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  29.21 
 
 		 1037 aa  320  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  29 
 
 		 997 aa  319  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.44 
 
 		 1050 aa  268  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  35.39 
 
 		 485 aa  261  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1122 aa  231  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1120 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1126 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1109 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 1041 aa  118  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  26.15 
 
 		 1056 aa  115  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1054 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  30.09 
 
 		 1203 aa  111  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 1176 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 1105 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 1232 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1008 aa  102  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1075 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1149 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  30.95 
 
 		 1081 aa  99  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 1188 aa  98.2  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1123 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1075 aa  96.3  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  28.99 
 
 		 1068 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.04 
 
 		 1195 aa  91.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 1123 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1206 aa  88.6  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1069 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 1114 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1161 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  30.53 
 
 		 1066 aa  87  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 1010 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26.37 
 
 		 1194 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  27.33 
 
 		 1057 aa  85.5  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1141 aa  85.1  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1125 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1077 aa  84.7  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  24.33 
 
 		 986 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  27.14 
 
 		 511 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  30.22 
 
 		 1061 aa  84.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1162 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1196 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1132 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1068 aa  82  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 1153 aa  81.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 1065 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1066 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1008 aa  77.8  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 1167 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  25.71 
 
 		 1010 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.2 
 
 		 1051 aa  77  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  29.81 
 
 		 1298 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1122 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.71 
 
 		 1008 aa  77  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1097 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1071 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  27.82 
 
 		 979 aa  74.7  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1074 aa  74.7  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  30.07 
 
 		 1041 aa  75.1  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 935 aa  74.3  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 1008 aa  74.3  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 897 aa  74.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1052 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  27.53 
 
 		 1210 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1074 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1053 aa  71.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  27.12 
 
 		 1125 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1129 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  27.52 
 
 		 1116 aa  70.1  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1105 aa  69.3  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1067 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 888 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1257 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.47 
 
 		 1162 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  27.38 
 
 		 992 aa  66.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 1026 aa  65.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  22.4 
 
 		 1012 aa  64.7  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1087 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1105 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1089 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 807 aa  59.3  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  25.43 
 
 		 788 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 1124 aa  58.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  25.36 
 
 		 966 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  26.5 
 
 		 960 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 791 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1016 aa  56.2  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1100 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 781 aa  55.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 781 aa  55.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 791 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>