More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0506 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  60.04 
 
 
578 aa  692  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  60.04 
 
 
578 aa  692  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  60.41 
 
 
596 aa  708  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  100 
 
 
544 aa  1127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  65.62 
 
 
586 aa  772  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  67.17 
 
 
584 aa  772  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  70.48 
 
 
581 aa  811  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  58.27 
 
 
585 aa  675  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  60.04 
 
 
578 aa  692  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  69.74 
 
 
591 aa  812  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  51.13 
 
 
587 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  49.72 
 
 
577 aa  558  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  43.28 
 
 
598 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  42.42 
 
 
589 aa  474  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  40.72 
 
 
556 aa  433  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  40.86 
 
 
561 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  41.22 
 
 
568 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 
555 aa  407  1e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  37.83 
 
 
559 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  39.56 
 
 
565 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  37.11 
 
 
559 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  36.73 
 
 
559 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  36.73 
 
 
559 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  36.73 
 
 
559 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  36.73 
 
 
559 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  36.6 
 
 
586 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  37.88 
 
 
586 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  36.81 
 
 
586 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  35.99 
 
 
575 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  34.4 
 
 
583 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  35.93 
 
 
578 aa  354  3e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 
589 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  34.4 
 
 
583 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  36.67 
 
 
575 aa  343  5e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  30.41 
 
 
493 aa  199  8e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  29.96 
 
 
491 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  29.98 
 
 
492 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  29.98 
 
 
492 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  29.98 
 
 
492 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  29.76 
 
 
492 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  29.89 
 
 
498 aa  188  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  29.39 
 
 
494 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  7.22293e-08 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  28.26 
 
 
508 aa  178  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  29.17 
 
 
494 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  3.50237e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  29.16 
 
 
493 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  29.36 
 
 
489 aa  176  9e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  29.17 
 
 
494 aa  176  1e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18626e-09 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  27.88 
 
 
482 aa  169  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  25.56 
 
 
645 aa  166  7e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 
644 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  26.77 
 
 
650 aa  164  4e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  26.57 
 
 
650 aa  164  4e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  27.49 
 
 
667 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 
651 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  27.49 
 
 
663 aa  160  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  26.37 
 
 
483 aa  157  5e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  24.29 
 
 
649 aa  157  5e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  27.57 
 
 
485 aa  156  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 
652 aa  156  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.23164e-05 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  26.36 
 
 
492 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
643 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  24.86 
 
 
636 aa  146  8e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  24.3 
 
 
1115 aa  145  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  24.49 
 
 
642 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  24.25 
 
 
1100 aa  142  1e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  28.1 
 
 
1088 aa  142  2e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  24.01 
 
 
650 aa  142  2e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  24.81 
 
 
1100 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  24.67 
 
 
1100 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 
638 aa  139  9e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  23.42 
 
 
551 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  23.15 
 
 
650 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  24.62 
 
 
1111 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  24.62 
 
 
1099 aa  138  3e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  22.72 
 
 
553 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  29.07 
 
 
558 aa  137  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  27.19 
 
 
1088 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  26.12 
 
 
645 aa  137  7e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  24.67 
 
 
672 aa  136  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  27.6 
 
 
1100 aa  136  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.62 
 
 
1088 aa  136  1e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  23.51 
 
 
1085 aa  135  1e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  23.91 
 
 
641 aa  136  1e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  24.29 
 
 
1112 aa  136  1e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  30.71 
 
 
1109 aa  135  2e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  23.36 
 
 
1100 aa  135  2e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  28.87 
 
 
1092 aa  135  2e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  23.45 
 
 
1098 aa  135  2e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  24.49 
 
 
1101 aa  135  2e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  23.09 
 
 
1088 aa  135  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  23.09 
 
 
1088 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 
657 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  24.6 
 
 
638 aa  134  4e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  30.36 
 
 
1142 aa  134  4e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  27.83 
 
 
1098 aa  134  4e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  27.92 
 
 
1099 aa  134  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  27.27 
 
 
1098 aa  134  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  24.26 
 
 
651 aa  134  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.26302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  23.51 
 
 
1102 aa  133  8e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  24.38 
 
 
1105 aa  133  8e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>