142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1331 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  100 
 
 		 508 aa  1051    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  57.24 
 
 		 493 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  55.56 
 
 		 491 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  51.8 
 
 		 492 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  52.01 
 
 		 492 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  52.22 
 
 		 492 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  52.01 
 
 		 492 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  51.26 
 
 		 494 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  51.26 
 
 		 494 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  51.26 
 
 		 494 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  51.04 
 
 		 498 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  50.85 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  40.17 
 
 		 483 aa  342  7e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  37.76 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  37.42 
 
 		 492 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  36.94 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  36.36 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  29.98 
 
 		 586 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  30.62 
 
 		 565 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  30.6 
 
 		 568 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  28.54 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  28.09 
 
 		 559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  27.9 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  27.9 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  27.9 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  28.09 
 
 		 559 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  29.5 
 
 		 598 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  28.73 
 
 		 591 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  27.31 
 
 		 585 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  28.51 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  27.91 
 
 		 559 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  25.27 
 
 		 583 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 589 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 583 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 		 561 aa  167  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  27.8 
 
 		 596 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  27 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  27.74 
 
 		 589 aa  160  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 		 586 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  26.05 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  27.17 
 
 		 581 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  28.57 
 
 		 556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  25.87 
 
 		 575 aa  156  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  28.26 
 
 		 544 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  27.98 
 
 		 584 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  26.52 
 
 		 578 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  26.52 
 
 		 578 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  26.52 
 
 		 578 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  27.22 
 
 		 587 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  28.77 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  23.09 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  27.12 
 
 		 661 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  24.92 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  22.37 
 
 		 651 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  25.89 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  23.77 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  25.62 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  22.22 
 
 		 639 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  24.62 
 
 		 551 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  20.41 
 
 		 644 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  26.04 
 
 		 1098 aa  54.3  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  25.93 
 
 		 1098 aa  53.9  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  29.69 
 
 		 539 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  25.45 
 
 		 645 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  37.76 
 
 		 556 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  26.06 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  24.66 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  23.29 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  25.23 
 
 		 641 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  22.96 
 
 		 652 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  24.89 
 
 		 638 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  25.52 
 
 		 1100 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  22.02 
 
 		 638 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  32.04 
 
 		 586 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  22.27 
 
 		 559 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  22.07 
 
 		 559 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  34.43 
 
 		 552 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  22.07 
 
 		 559 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  22.39 
 
 		 556 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  24.21 
 
 		 1105 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  26.43 
 
 		 1130 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  31.07 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  31.07 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  31.07 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  31.07 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  30.1 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  22.07 
 
 		 559 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  24.27 
 
 		 548 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  26.88 
 
 		 649 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  26 
 
 		 558 aa  49.3  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  30.1 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  30.1 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  25.36 
 
 		 645 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  22.73 
 
 		 567 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  22.27 
 
 		 1116 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  20.75 
 
 		 553 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  31.25 
 
 		 594 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  21.83 
 
 		 1116 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>