More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1771 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  58.27 
 
 		 544 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  55.19 
 
 		 584 aa  693    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  57.88 
 
 		 596 aa  720    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  56.24 
 
 		 586 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  58.15 
 
 		 581 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 585 aa  1223    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  55.11 
 
 		 591 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  61.15 
 
 		 578 aa  756    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  61.15 
 
 		 578 aa  756    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  61.15 
 
 		 578 aa  756    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  47.58 
 
 		 587 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  48.69 
 
 		 577 aa  586  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  44.12 
 
 		 589 aa  525  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  44.26 
 
 		 598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  43.49 
 
 		 568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  40.28 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  40.49 
 
 		 561 aa  432  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  38.88 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  40.61 
 
 		 559 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  39.05 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  39.05 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  39.05 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  39.05 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  39.23 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  41.75 
 
 		 565 aa  402  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 		 586 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  38 
 
 		 586 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  39.02 
 
 		 578 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  39.13 
 
 		 586 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  38.18 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  37.13 
 
 		 583 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  37.92 
 
 		 589 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  38.12 
 
 		 575 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  36.94 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  29.4 
 
 		 493 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  27.2 
 
 		 483 aa  179  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  28.29 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  29.04 
 
 		 491 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  27.61 
 
 		 492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  27.17 
 
 		 492 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  26.96 
 
 		 492 aa  173  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  26.96 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  27.16 
 
 		 492 aa  172  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  27.31 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  26.55 
 
 		 482 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  27.01 
 
 		 485 aa  169  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  27.11 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  28.52 
 
 		 663 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  26.9 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  26.02 
 
 		 493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  26.68 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  26.4 
 
 		 641 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  26.04 
 
 		 649 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  26.87 
 
 		 498 aa  159  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  26.78 
 
 		 650 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  32.74 
 
 		 548 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  27.13 
 
 		 646 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  26.63 
 
 		 652 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  27.07 
 
 		 672 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  24.9 
 
 		 650 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  27.66 
 
 		 651 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  25.95 
 
 		 644 aa  148  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  25.48 
 
 		 645 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 		 534 aa  143  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  30.18 
 
 		 1100 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  24.67 
 
 		 1152 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 667 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  25.22 
 
 		 638 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  30.29 
 
 		 558 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  23.32 
 
 		 1101 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  30.55 
 
 		 1098 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  24.72 
 
 		 1131 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  28.83 
 
 		 1102 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  24.72 
 
 		 1131 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  28.83 
 
 		 1102 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  24.72 
 
 		 1131 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  24.72 
 
 		 1131 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  24.11 
 
 		 1114 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  24.72 
 
 		 1131 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  24.72 
 
 		 1131 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  23.89 
 
 		 1085 aa  137  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  23.25 
 
 		 1100 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 		 643 aa  136  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  30.07 
 
 		 1088 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  30.91 
 
 		 1098 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  30.07 
 
 		 1088 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  23.68 
 
 		 1137 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  24.17 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  23.68 
 
 		 1137 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  23.68 
 
 		 1137 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  29.96 
 
 		 1088 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  31.16 
 
 		 1136 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  25.71 
 
 		 651 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  23.19 
 
 		 1102 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  23.69 
 
 		 1154 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.09 
 
 		 1092 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  30 
 
 		 1100 aa  134  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  30.07 
 
 		 1105 aa  134  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  24.76 
 
 		 650 aa  134  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  29.82 
 
 		 1099 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>