More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2243 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 575 aa  1165    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  80 
 
 		 575 aa  907    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  52.81 
 
 		 578 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  49.39 
 
 		 589 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  49.39 
 
 		 586 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  49.65 
 
 		 586 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  49.13 
 
 		 586 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  46.7 
 
 		 583 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  46.34 
 
 		 583 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  37.93 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  35.33 
 
 		 591 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  38.18 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  38.09 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  38.09 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  38.09 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  38.46 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  35.33 
 
 		 596 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  35.28 
 
 		 586 aa  363  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  34.51 
 
 		 581 aa  353  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  34.55 
 
 		 555 aa  346  8e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  33.87 
 
 		 589 aa  341  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  31.52 
 
 		 584 aa  340  4e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  36.64 
 
 		 556 aa  340  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  35.57 
 
 		 544 aa  339  8e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  32.81 
 
 		 565 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  37.31 
 
 		 568 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  35.98 
 
 		 598 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  29.46 
 
 		 561 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  32.57 
 
 		 559 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  31.87 
 
 		 559 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  31.87 
 
 		 559 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  31.87 
 
 		 559 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  31.87 
 
 		 559 aa  312  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  32 
 
 		 559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  31.51 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  28.77 
 
 		 493 aa  170  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  26.02 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  26.19 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  25.73 
 
 		 494 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  24.75 
 
 		 492 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  24.85 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  24.75 
 
 		 492 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  25.45 
 
 		 483 aa  159  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  24.75 
 
 		 492 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  25.87 
 
 		 508 aa  156  9e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  28.98 
 
 		 638 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  25.75 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  25.78 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  25.24 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  26.62 
 
 		 644 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  27.75 
 
 		 663 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  23.09 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  26.22 
 
 		 638 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  30.72 
 
 		 641 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  26.86 
 
 		 636 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  25.11 
 
 		 498 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  26.7 
 
 		 650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  25.29 
 
 		 482 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  25.16 
 
 		 645 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  22.41 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  26.47 
 
 		 643 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  27.05 
 
 		 1092 aa  127  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  26.38 
 
 		 650 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  25.74 
 
 		 652 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  28.33 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  27.62 
 
 		 1116 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  28.62 
 
 		 558 aa  124  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  27.3 
 
 		 1116 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  22.86 
 
 		 1098 aa  124  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  23.36 
 
 		 1099 aa  124  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  24.13 
 
 		 1100 aa  123  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  29.49 
 
 		 650 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  23 
 
 		 548 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  24.27 
 
 		 1110 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  25.37 
 
 		 651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  25.63 
 
 		 1088 aa  122  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  25.38 
 
 		 1088 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  25.38 
 
 		 1088 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  23.23 
 
 		 1121 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  27.79 
 
 		 572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  24.21 
 
 		 1102 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  27.79 
 
 		 553 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  24.46 
 
 		 1115 aa  120  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  27.51 
 
 		 572 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 672 aa  120  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  28.21 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  24.04 
 
 		 1102 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  23.86 
 
 		 1102 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  28.04 
 
 		 562 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  23.63 
 
 		 1105 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  25.63 
 
 		 1088 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  23.68 
 
 		 1098 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  24.75 
 
 		 551 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  27.27 
 
 		 598 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  28.83 
 
 		 598 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 		 657 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  23.73 
 
 		 1121 aa  117  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  26.03 
 
 		 1085 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  23.38 
 
 		 1098 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>