230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01971 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  100 
 
 		 498 aa  1029    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  59.07 
 
 		 493 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  59.48 
 
 		 492 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  59.28 
 
 		 492 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  59.28 
 
 		 492 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  59.48 
 
 		 492 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  59.76 
 
 		 494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  59.56 
 
 		 494 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  59.76 
 
 		 494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  53.99 
 
 		 493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  51.04 
 
 		 508 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  50.4 
 
 		 491 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  38.92 
 
 		 482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  37.58 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  37.17 
 
 		 489 aa  317  4e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  38.03 
 
 		 492 aa  316  6e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  36.71 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  29.76 
 
 		 586 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  30.11 
 
 		 591 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  29.34 
 
 		 559 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  30.97 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  29.27 
 
 		 559 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 		 559 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  29.27 
 
 		 559 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 		 559 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  29.89 
 
 		 555 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  29.47 
 
 		 559 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  29.06 
 
 		 565 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  30.3 
 
 		 568 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  30.26 
 
 		 589 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  28.6 
 
 		 584 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 		 578 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 		 578 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 		 578 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  30.11 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  27.53 
 
 		 577 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  28.11 
 
 		 596 aa  163  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  31.14 
 
 		 598 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 		 585 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  28.39 
 
 		 581 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  27.97 
 
 		 587 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  25.27 
 
 		 583 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 583 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 589 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  25.84 
 
 		 575 aa  133  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  25.11 
 
 		 575 aa  133  9e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 586 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  26.75 
 
 		 586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  21.81 
 
 		 1108 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  25.73 
 
 		 1113 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  24.08 
 
 		 644 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  24.39 
 
 		 588 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  23.05 
 
 		 1116 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  23.4 
 
 		 1116 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.18 
 
 		 1088 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.18 
 
 		 1088 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  27.73 
 
 		 1088 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  23.15 
 
 		 1121 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  24.08 
 
 		 1109 aa  70.9  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  24.24 
 
 		 548 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  22.5 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  22.2 
 
 		 661 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  23.96 
 
 		 567 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  29.06 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  25.45 
 
 		 1123 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  25.79 
 
 		 551 aa  67  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  25.18 
 
 		 585 aa  67  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  23.53 
 
 		 1088 aa  66.6  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  24.91 
 
 		 1110 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  23.68 
 
 		 1099 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  23.32 
 
 		 645 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  24.51 
 
 		 1098 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  23.41 
 
 		 672 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  27.85 
 
 		 1098 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  24.62 
 
 		 1100 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  25.23 
 
 		 1139 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  24.32 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  22.74 
 
 		 667 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  23.59 
 
 		 1108 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  23.63 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  25.23 
 
 		 1121 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  24.31 
 
 		 1088 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  27.27 
 
 		 1092 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  24.91 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  23.36 
 
 		 1100 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  25.43 
 
 		 1130 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  23.03 
 
 		 1100 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  24.35 
 
 		 1094 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  27.78 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  23.78 
 
 		 1101 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  22.52 
 
 		 652 aa  63.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  21.49 
 
 		 1119 aa  63.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  21.55 
 
 		 598 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  23.86 
 
 		 1100 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  25.17 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>