More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1813 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  95.35 
 
 
559 aa  1120    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  95.17 
 
 
559 aa  1116    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  64.76 
 
 
565 aa  768    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  94.99 
 
 
559 aa  1115    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  95.35 
 
 
559 aa  1120    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  95.35 
 
 
559 aa  1120    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  100 
 
 
559 aa  1170    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 
561 aa  561  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  44.74 
 
 
568 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  46.87 
 
 
556 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  45.99 
 
 
555 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  41.81 
 
 
598 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  40.17 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  39.72 
 
 
589 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  42.72 
 
 
578 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  42.72 
 
 
578 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  42.72 
 
 
578 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  40.61 
 
 
585 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  41.25 
 
 
596 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  39.69 
 
 
577 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  39.96 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  39.35 
 
 
591 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  39.77 
 
 
581 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  38.08 
 
 
587 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  37.83 
 
 
544 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 
586 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  32.4 
 
 
589 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  32.47 
 
 
586 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
586 aa  319  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 
583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  32.26 
 
 
583 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  32 
 
 
575 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  34.47 
 
 
575 aa  306  6e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 
578 aa  303  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1549  putative sucrose phosphorylase  89.23 
 
 
141 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  31.58 
 
 
492 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  31.16 
 
 
492 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  31.37 
 
 
492 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  31.37 
 
 
492 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  31.89 
 
 
494 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  31.67 
 
 
494 aa  200  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  31.67 
 
 
494 aa  199  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  30.87 
 
 
491 aa  191  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  28.12 
 
 
483 aa  191  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  29.43 
 
 
493 aa  187  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  29.13 
 
 
493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  26.52 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  27.62 
 
 
485 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  29.47 
 
 
498 aa  176  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  26.97 
 
 
649 aa  173  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  28.01 
 
 
645 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  27.91 
 
 
508 aa  169  9e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  26.08 
 
 
492 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  27.17 
 
 
644 aa  167  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 
650 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  26.83 
 
 
482 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  27.69 
 
 
651 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  26.18 
 
 
643 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  26.76 
 
 
651 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  25.98 
 
 
652 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  26.53 
 
 
646 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 
663 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  25.6 
 
 
650 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  26.26 
 
 
548 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 
534 aa  147  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  25.05 
 
 
650 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  25.92 
 
 
638 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 
667 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 
672 aa  140  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  24.04 
 
 
636 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  27.02 
 
 
587 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 
657 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  24.66 
 
 
1119 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  24.65 
 
 
567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  24.22 
 
 
591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  25.2 
 
 
591 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 
641 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  23.42 
 
 
1061 aa  134  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  23.98 
 
 
588 aa  134  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  25.38 
 
 
572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  23.67 
 
 
1110 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  27.32 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  25.38 
 
 
553 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  26.17 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  25.19 
 
 
571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  24.39 
 
 
642 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  25.59 
 
 
556 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  26.04 
 
 
1099 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  25.19 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  24.95 
 
 
610 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  25.63 
 
 
1098 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  24.85 
 
 
1100 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  25.83 
 
 
577 aa  128  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  23.81 
 
 
1100 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  25.89 
 
 
567 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 
639 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  23.36 
 
 
1112 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.79 
 
 
1093 aa  127  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  25.95 
 
 
596 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  25.95 
 
 
596 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>