278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0384 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  79.88 
 
 		 485 aa  814    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  63.2 
 
 		 483 aa  656    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  72.97 
 
 		 489 aa  754    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  100 
 
 		 492 aa  1009    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  47.45 
 
 		 482 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  37.31 
 
 		 493 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  40 
 
 		 494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  40.23 
 
 		 492 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  39.77 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  39.77 
 
 		 494 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  40.27 
 
 		 494 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  39.55 
 
 		 492 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  39.32 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  34.95 
 
 		 491 aa  316  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  38.03 
 
 		 498 aa  316  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  37.42 
 
 		 508 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  38.41 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  29.39 
 
 		 591 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  30.74 
 
 		 589 aa  180  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  26.86 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  26.86 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  26.86 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  26.86 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  26.86 
 
 		 559 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  26.38 
 
 		 565 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 583 aa  173  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  27.16 
 
 		 585 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  27.9 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  28.85 
 
 		 586 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  26.68 
 
 		 583 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  26.08 
 
 		 559 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  29.04 
 
 		 584 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  27.74 
 
 		 556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  27.05 
 
 		 596 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  30 
 
 		 598 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  28.89 
 
 		 568 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  27.61 
 
 		 578 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  27.61 
 
 		 578 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  27.61 
 
 		 578 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  26.79 
 
 		 577 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  27.91 
 
 		 587 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  25.93 
 
 		 581 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  24.75 
 
 		 575 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 		 561 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  25.24 
 
 		 575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  26.36 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 578 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  25.2 
 
 		 586 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  24.32 
 
 		 586 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  25.79 
 
 		 644 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  26.91 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  24.29 
 
 		 638 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  26.28 
 
 		 636 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  23 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  23.4 
 
 		 1139 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  21.76 
 
 		 1142 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  20.87 
 
 		 1095 aa  60.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  23.32 
 
 		 1102 aa  60.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  23.32 
 
 		 1102 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  22.19 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  25.13 
 
 		 1113 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  24.15 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  21.85 
 
 		 1108 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  22.57 
 
 		 1137 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  20.95 
 
 		 1109 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  23.32 
 
 		 1102 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  23.83 
 
 		 1123 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  22.42 
 
 		 1116 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  19.59 
 
 		 1116 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  22.75 
 
 		 1154 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  22.83 
 
 		 1137 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  22.83 
 
 		 1137 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  22.83 
 
 		 1137 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  21.25 
 
 		 1104 aa  58.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  26.41 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  22.52 
 
 		 1136 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  23.81 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  21.43 
 
 		 1152 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  22.49 
 
 		 1154 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  21.86 
 
 		 1108 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  22.57 
 
 		 1137 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  21.09 
 
 		 1098 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  25.94 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  26.41 
 
 		 610 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  23.58 
 
 		 1061 aa  57  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  21.72 
 
 		 1121 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  27.51 
 
 		 645 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  24.34 
 
 		 558 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  22.75 
 
 		 1108 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  22.68 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  23.6 
 
 		 562 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  24.34 
 
 		 548 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  22.31 
 
 		 1138 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  24.41 
 
 		 650 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  25 
 
 		 591 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  21.67 
 
 		 1093 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>