More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2600 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  69.74 
 
 		 544 aa  793    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  55.1 
 
 		 596 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  65.56 
 
 		 586 aa  808    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  68.92 
 
 		 581 aa  825    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  55.11 
 
 		 585 aa  669    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  62.13 
 
 		 584 aa  766    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  100 
 
 		 591 aa  1231    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  58.81 
 
 		 578 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  58.81 
 
 		 578 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  58.81 
 
 		 578 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  48.81 
 
 		 587 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  47.64 
 
 		 577 aa  571  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  42.91 
 
 		 598 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  39.4 
 
 		 589 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  39.65 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  39.81 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  40.66 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  39.35 
 
 		 559 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  40.38 
 
 		 559 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  40.19 
 
 		 559 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  40.19 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  40.19 
 
 		 559 aa  399  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  40.19 
 
 		 559 aa  399  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  39.08 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  35.33 
 
 		 575 aa  385  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  37.55 
 
 		 565 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  36.04 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  34.47 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  34.85 
 
 		 583 aa  363  6e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  34.71 
 
 		 583 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 589 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  34.03 
 
 		 575 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 578 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  29.01 
 
 		 491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  31.58 
 
 		 489 aa  196  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  30.84 
 
 		 493 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  30.11 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  29.59 
 
 		 483 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  28.86 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  29.39 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  28.86 
 
 		 492 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  28.86 
 
 		 492 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  28.66 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  28.57 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  29.69 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  29.48 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  28.6 
 
 		 482 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  28.73 
 
 		 508 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  29.26 
 
 		 494 aa  170  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  28.63 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  25.68 
 
 		 1088 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 650 aa  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 644 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  23.78 
 
 		 1092 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  25.5 
 
 		 650 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  24.44 
 
 		 645 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 663 aa  147  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  24.11 
 
 		 1100 aa  147  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  23.71 
 
 		 1085 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  24.19 
 
 		 1101 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  23.98 
 
 		 1088 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  23.75 
 
 		 1088 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  24.08 
 
 		 1088 aa  144  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  24.08 
 
 		 1088 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  24.39 
 
 		 1115 aa  143  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  23.69 
 
 		 1131 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  28.22 
 
 		 651 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  23.69 
 
 		 1131 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  23.69 
 
 		 1131 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  23.69 
 
 		 1131 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  23.69 
 
 		 1131 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  23.69 
 
 		 1131 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  23.56 
 
 		 1100 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  24.72 
 
 		 650 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  23.32 
 
 		 1093 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  23.94 
 
 		 1100 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  23.75 
 
 		 548 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  24.47 
 
 		 1105 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  23.19 
 
 		 1137 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  23.19 
 
 		 1137 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  23.81 
 
 		 1137 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  23.19 
 
 		 1137 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  24.34 
 
 		 1105 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  23.94 
 
 		 1100 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  23.84 
 
 		 650 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  23.76 
 
 		 1137 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  24.47 
 
 		 1105 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  23.52 
 
 		 1093 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  23.14 
 
 		 1154 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  23.23 
 
 		 1154 aa  138  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  23.12 
 
 		 1108 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  23.32 
 
 		 1152 aa  137  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  23.01 
 
 		 1138 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  23.52 
 
 		 1113 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  30.66 
 
 		 1142 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  23.43 
 
 		 652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  24.29 
 
 		 1108 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  26.09 
 
 		 551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  23.33 
 
 		 1098 aa  135  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>