More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_06751 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  55.71 
 
 		 583 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  58.84 
 
 		 586 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  58.74 
 
 		 586 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  56.08 
 
 		 583 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 578 aa  1192    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  58.58 
 
 		 589 aa  705    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  58.82 
 
 		 586 aa  691    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  52.81 
 
 		 575 aa  628  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  54.29 
 
 		 575 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  39.02 
 
 		 585 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  35.03 
 
 		 577 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  35.54 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  35.54 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  35.54 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  35.76 
 
 		 587 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  35.05 
 
 		 589 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  35.39 
 
 		 596 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  37.71 
 
 		 555 aa  363  6e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  34.86 
 
 		 598 aa  361  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  34.72 
 
 		 591 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  34.03 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  34.79 
 
 		 561 aa  352  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  32.51 
 
 		 584 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  37.45 
 
 		 556 aa  349  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  35.93 
 
 		 544 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  36.85 
 
 		 581 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  31.88 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  32.95 
 
 		 559 aa  320  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  32.76 
 
 		 559 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  32.76 
 
 		 559 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  32.76 
 
 		 559 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  32.76 
 
 		 559 aa  319  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  31.62 
 
 		 559 aa  316  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  33.68 
 
 		 565 aa  307  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  26.55 
 
 		 494 aa  170  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  26.34 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  26.12 
 
 		 494 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  26.15 
 
 		 493 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  29.04 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  26.15 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  25.93 
 
 		 492 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  25.93 
 
 		 492 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  25.71 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  25.05 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  26.91 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  26.84 
 
 		 638 aa  147  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  25.05 
 
 		 492 aa  143  8e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  26 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  24.8 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  24.37 
 
 		 489 aa  137  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  28.24 
 
 		 498 aa  136  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  25.41 
 
 		 650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  24.96 
 
 		 644 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  25.57 
 
 		 651 aa  133  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  25.24 
 
 		 636 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  25.36 
 
 		 650 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  25.98 
 
 		 651 aa  124  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  27.48 
 
 		 663 aa  124  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  24.34 
 
 		 482 aa  124  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  23.56 
 
 		 643 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  26.41 
 
 		 558 aa  121  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  28.23 
 
 		 650 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 657 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  23.83 
 
 		 641 aa  120  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 639 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  23.99 
 
 		 652 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  23.27 
 
 		 551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  24.75 
 
 		 645 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  27.16 
 
 		 556 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  25.58 
 
 		 1094 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  25.71 
 
 		 1139 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  25.63 
 
 		 1092 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.18 
 
 		 1085 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  24.76 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  25.24 
 
 		 553 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  27.11 
 
 		 606 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  26.62 
 
 		 548 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  25.46 
 
 		 1088 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  25.46 
 
 		 1088 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  27.84 
 
 		 567 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  23.63 
 
 		 1108 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  24.14 
 
 		 572 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  24.14 
 
 		 553 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  24.54 
 
 		 1088 aa  113  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  23.58 
 
 		 572 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  25.61 
 
 		 1114 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  26.02 
 
 		 1123 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  25.09 
 
 		 1088 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  27.87 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  27.48 
 
 		 1142 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  26.76 
 
 		 1088 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  25.45 
 
 		 1100 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  29.45 
 
 		 649 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  22.47 
 
 		 1115 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  27.66 
 
 		 1112 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  27.11 
 
 		 1110 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  28.1 
 
 		 682 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  26.28 
 
 		 1119 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  22.52 
 
 		 638 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>