More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1522 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  51.49 
 
 		 1043 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  95.88 
 
 		 655 aa  1287    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  100 
 
 		 655 aa  1333    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  48.51 
 
 		 647 aa  618  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  47.6 
 
 		 852 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  47.76 
 
 		 850 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  47.44 
 
 		 852 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  47.44 
 
 		 852 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  47.44 
 
 		 848 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  47.6 
 
 		 852 aa  572  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  47.12 
 
 		 848 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  46.81 
 
 		 852 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  46.81 
 
 		 852 aa  544  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  46.19 
 
 		 856 aa  535  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  43.99 
 
 		 843 aa  525  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  44.04 
 
 		 843 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  46.17 
 
 		 640 aa  515  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  43.49 
 
 		 899 aa  511  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  43.19 
 
 		 842 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  43.83 
 
 		 1136 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  42.22 
 
 		 2638 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  41.32 
 
 		 841 aa  482  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  40.77 
 
 		 1888 aa  473  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  39.94 
 
 		 874 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  39.5 
 
 		 718 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  40.16 
 
 		 713 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  41.74 
 
 		 1064 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  39.84 
 
 		 713 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  40.16 
 
 		 713 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  39.84 
 
 		 713 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  40.16 
 
 		 713 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  41.26 
 
 		 1064 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  39.44 
 
 		 713 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  39.16 
 
 		 713 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  39.63 
 
 		 713 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  41.14 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  39.38 
 
 		 713 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  39.9 
 
 		 825 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  38.99 
 
 		 713 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  38.09 
 
 		 712 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  40.12 
 
 		 928 aa  415  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  40.29 
 
 		 640 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  39.06 
 
 		 669 aa  393  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  39.57 
 
 		 766 aa  391  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.54 
 
 		 1117 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.83 
 
 		 1176 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.05 
 
 		 891 aa  334  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  31.07 
 
 		 1062 aa  311  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  28.71 
 
 		 998 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  29.31 
 
 		 1942 aa  296  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.16 
 
 		 1035 aa  296  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.49 
 
 		 2156 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.44 
 
 		 1025 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.63 
 
 		 946 aa  287  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  29.29 
 
 		 1429 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.9 
 
 		 991 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  28.41 
 
 		 1432 aa  283  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.03 
 
 		 1331 aa  281  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.01 
 
 		 1855 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  29.21 
 
 		 1329 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  28.99 
 
 		 1328 aa  276  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.69 
 
 		 1248 aa  273  7e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  30.36 
 
 		 1252 aa  272  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.48 
 
 		 1891 aa  269  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  29.51 
 
 		 776 aa  263  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.07 
 
 		 1441 aa  257  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.46 
 
 		 1440 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.46 
 
 		 1440 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.74 
 
 		 2068 aa  256  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  27.56 
 
 		 1472 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.56 
 
 		 1975 aa  253  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.12 
 
 		 1450 aa  250  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.92 
 
 		 1124 aa  237  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  27.65 
 
 		 700 aa  194  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  25.59 
 
 		 817 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  27.33 
 
 		 705 aa  184  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  29.22 
 
 		 774 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  27.44 
 
 		 706 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  29.19 
 
 		 717 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  28.53 
 
 		 729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  26.6 
 
 		 709 aa  181  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  25.6 
 
 		 721 aa  180  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  26.94 
 
 		 708 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  26.72 
 
 		 718 aa  178  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  28.76 
 
 		 694 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  28.76 
 
 		 694 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  28.34 
 
 		 711 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  27.15 
 
 		 693 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  27.8 
 
 		 696 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  28.22 
 
 		 693 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  28.34 
 
 		 711 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  29.04 
 
 		 695 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  25.96 
 
 		 718 aa  173  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  25.41 
 
 		 711 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  26.09 
 
 		 683 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  26.47 
 
 		 701 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  27.99 
 
 		 704 aa  171  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  25.88 
 
 		 706 aa  170  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  27.11 
 
 		 706 aa  170  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  25.85 
 
 		 715 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>