119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0010 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  31.11 
 
 		 1722 aa  685    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  33.44 
 
 		 1669 aa  830    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  32.48 
 
 		 1669 aa  801    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  35.59 
 
 		 2098 aa  799    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  32.61 
 
 		 1726 aa  750    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  31.12 
 
 		 1706 aa  729    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  31.88 
 
 		 1703 aa  692    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  31.58 
 
 		 1700 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 1516 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  28.38 
 
 		 1925 aa  652    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  30.93 
 
 		 1697 aa  692    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  30.43 
 
 		 1649 aa  656    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  31.41 
 
 		 1642 aa  788    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  100 
 
 		 1932 aa  3956    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  81.43 
 
 		 1934 aa  3188    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1748 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  30.53 
 
 		 1702 aa  679    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  39.89 
 
 		 2117 aa  1243    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  31.84 
 
 		 1697 aa  692    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  30.82 
 
 		 1693 aa  706    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  31.25 
 
 		 1701 aa  710    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  34.72 
 
 		 2077 aa  815    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  29.58 
 
 		 1606 aa  633  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  29.46 
 
 		 1575 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  31.57 
 
 		 1417 aa  628  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  29.04 
 
 		 2570 aa  603  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 1674 aa  579  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  27.69 
 
 		 1956 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  31.73 
 
 		 2274 aa  475  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  29.32 
 
 		 1211 aa  447  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  28.25 
 
 		 2005 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 1594 aa  386  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  28.29 
 
 		 976 aa  355  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  33.58 
 
 		 761 aa  275  8.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  41.53 
 
 		 766 aa  266  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  33.21 
 
 		 763 aa  260  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  31.08 
 
 		 470 aa  176  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  30.88 
 
 		 526 aa  130  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  25.52 
 
 		 1328 aa  106  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  27.24 
 
 		 577 aa  90.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  24.38 
 
 		 1379 aa  90.1  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  30.69 
 
 		 284 aa  85.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.34 
 
 		 678 aa  72.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  25.4 
 
 		 484 aa  71.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1125  hypothetical protein  93.94 
 
 		 39 aa  64.3  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  26.92 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  24.38 
 
 		 489 aa  61.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  24.38 
 
 		 489 aa  61.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  23.47 
 
 		 479 aa  56.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  24.42 
 
 		 489 aa  56.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  35.05 
 
 		 894 aa  56.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  26.92 
 
 		 341 aa  55.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  30.99 
 
 		 958 aa  55.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 530 aa  55.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  26.92 
 
 		 341 aa  55.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  30.99 
 
 		 958 aa  55.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  24.38 
 
 		 481 aa  54.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  24.11 
 
 		 499 aa  53.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  25.58 
 
 		 518 aa  53.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  25.58 
 
 		 518 aa  53.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  26.39 
 
 		 518 aa  53.5  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  25.58 
 
 		 518 aa  53.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  25.58 
 
 		 518 aa  53.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 479 aa  53.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.79 
 
 		 933 aa  53.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  30.7 
 
 		 246 aa  53.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  28.49 
 
 		 527 aa  53.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  24.31 
 
 		 515 aa  53.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  24.88 
 
 		 493 aa  52.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  26.85 
 
 		 493 aa  52.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  23.97 
 
 		 481 aa  51.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  25.58 
 
 		 339 aa  52.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 		 500 aa  51.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  32.29 
 
 		 969 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  24.29 
 
 		 484 aa  51.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  22.66 
 
 		 477 aa  50.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  23.53 
 
 		 481 aa  50.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  22.35 
 
 		 478 aa  50.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  23.53 
 
 		 515 aa  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 		 501 aa  50.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  39.39 
 
 		 900 aa  50.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  23.97 
 
 		 969 aa  49.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  32.03 
 
 		 1194 aa  50.1  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  22.59 
 
 		 517 aa  49.7  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  24.55 
 
 		 707 aa  49.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  23.71 
 
 		 523 aa  49.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  31.45 
 
 		 515 aa  49.3  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  27.52 
 
 		 488 aa  48.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  30.26 
 
 		 898 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  34.25 
 
 		 1069 aa  48.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  23.71 
 
 		 523 aa  48.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  34.25 
 
 		 1069 aa  48.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  30.26 
 
 		 892 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.4 
 
 		 530 aa  48.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  30.26 
 
 		 898 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  24.31 
 
 		 495 aa  47.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  26.67 
 
 		 919 aa  47.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  25.45 
 
 		 500 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 905 aa  47.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 554 aa  47.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>