111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2455 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  100 
 
 
691 aa  1390    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  26.86 
 
 
770 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  27.23 
 
 
769 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.83 
 
 
770 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.58 
 
 
770 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  26.58 
 
 
770 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  25.21 
 
 
770 aa  183  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  25.56 
 
 
769 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  24.72 
 
 
768 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  24.93 
 
 
769 aa  180  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  24.67 
 
 
770 aa  177  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  27.16 
 
 
519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  23.1 
 
 
772 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  31.89 
 
 
291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.98 
 
 
530 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  29.68 
 
 
621 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  29.3 
 
 
534 aa  130  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  26.34 
 
 
449 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  27.87 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  33.17 
 
 
274 aa  101  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  24.96 
 
 
755 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  26.21 
 
 
755 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  24.17 
 
 
759 aa  94.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  30.89 
 
 
332 aa  92.8  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  25.37 
 
 
757 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  27.92 
 
 
327 aa  91.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  26.64 
 
 
361 aa  87  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  25.95 
 
 
818 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  28.36 
 
 
300 aa  83.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  27.99 
 
 
722 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  27.99 
 
 
722 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  26.62 
 
 
838 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  26.82 
 
 
722 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  30.91 
 
 
197 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  26.28 
 
 
838 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  28.78 
 
 
226 aa  80.1  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  27.99 
 
 
722 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  26.62 
 
 
838 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  26.96 
 
 
836 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  26.06 
 
 
720 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  26.06 
 
 
720 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  26.06 
 
 
720 aa  77.8  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  35.51 
 
 
171 aa  75.1  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  22.2 
 
 
566 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  21.89 
 
 
566 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  22.34 
 
 
566 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  24.78 
 
 
746 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  28.97 
 
 
816 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  23.3 
 
 
566 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  26.85 
 
 
239 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  22.37 
 
 
580 aa  72  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  21.84 
 
 
602 aa  72  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  26.53 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  28.19 
 
 
816 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  23.03 
 
 
566 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  23.46 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  21.94 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  22.88 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  22.27 
 
 
571 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  25 
 
 
354 aa  67  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  32.58 
 
 
203 aa  65.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  29.63 
 
 
351 aa  65.1  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  26.43 
 
 
180 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  29.91 
 
 
134 aa  64.3  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  29.82 
 
 
175 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  24.41 
 
 
816 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  29.37 
 
 
178 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  28.29 
 
 
440 aa  60.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  24.88 
 
 
238 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  27.98 
 
 
614 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  23.3 
 
 
580 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  28.07 
 
 
175 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  27.49 
 
 
230 aa  57.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  25.9 
 
 
181 aa  57.4  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  21.46 
 
 
577 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  22.06 
 
 
576 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  27.34 
 
 
188 aa  57  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  20.88 
 
 
577 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3096  MORN variant repeat protein  30.99 
 
 
204 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.102231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  24.05 
 
 
468 aa  55.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  28.43 
 
 
187 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  25.71 
 
 
577 aa  55.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  22.85 
 
 
577 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  22.06 
 
 
576 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  33.04 
 
 
199 aa  53.9  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266583 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  21.58 
 
 
576 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  29.3 
 
 
203 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  29.81 
 
 
108 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  25.86 
 
 
684 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  23.39 
 
 
576 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 
351 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1250  hypothetical protein  37.66 
 
 
115 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220224  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  27.27 
 
 
159 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  22.84 
 
 
424 aa  49.7  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.29 
 
 
590 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1304  hypothetical protein  30.38 
 
 
154 aa  49.3  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  29.35 
 
 
357 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  27.31 
 
 
500 aa  48.1  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.416244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>