More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06600 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  59.68 
 
 		 704 aa  830    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  100 
 
 		 657 aa  1336    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  57.6 
 
 		 656 aa  773    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  53.42 
 
 		 660 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  52.35 
 
 		 673 aa  479  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  40.28 
 
 		 653 aa  472  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37.27 
 
 		 674 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  49.34 
 
 		 703 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  47.32 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  38.46 
 
 		 640 aa  434  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  36.12 
 
 		 619 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  40 
 
 		 632 aa  340  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  38.95 
 
 		 636 aa  330  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  38.32 
 
 		 630 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  38.43 
 
 		 660 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  38.78 
 
 		 632 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  38.6 
 
 		 595 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  31.84 
 
 		 582 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.54 
 
 		 583 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  37.6 
 
 		 631 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  34.16 
 
 		 587 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  35.14 
 
 		 633 aa  300  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.15 
 
 		 588 aa  299  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.02 
 
 		 599 aa  296  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.43 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.81 
 
 		 601 aa  294  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.63 
 
 		 613 aa  293  9e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.03 
 
 		 588 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.71 
 
 		 584 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.24 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.63 
 
 		 600 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.01 
 
 		 598 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.01 
 
 		 598 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.01 
 
 		 598 aa  282  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.01 
 
 		 598 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.01 
 
 		 598 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.01 
 
 		 571 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.01 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.01 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.58 
 
 		 598 aa  280  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.28 
 
 		 600 aa  280  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  36.38 
 
 		 539 aa  279  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  32.31 
 
 		 595 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  32.57 
 
 		 595 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  32.61 
 
 		 604 aa  277  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  33.41 
 
 		 614 aa  276  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  35.18 
 
 		 599 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.17 
 
 		 605 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.47 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36 
 
 		 544 aa  273  9e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  32.43 
 
 		 598 aa  273  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34 
 
 		 626 aa  273  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  36.85 
 
 		 596 aa  269  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  35.45 
 
 		 638 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.59 
 
 		 604 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  30.4 
 
 		 601 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.47 
 
 		 601 aa  267  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  29.53 
 
 		 593 aa  267  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  34.16 
 
 		 684 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  33.57 
 
 		 605 aa  261  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  33.57 
 
 		 605 aa  261  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  32.97 
 
 		 605 aa  261  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  33.12 
 
 		 660 aa  260  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 604 aa  260  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  29.14 
 
 		 599 aa  260  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  35.51 
 
 		 682 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  32.94 
 
 		 686 aa  258  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  33.19 
 
 		 694 aa  257  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  33.33 
 
 		 676 aa  256  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  29.74 
 
 		 617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  32.74 
 
 		 663 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  34.38 
 
 		 647 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  32.6 
 
 		 664 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  34 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  34.79 
 
 		 617 aa  251  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  31.98 
 
 		 655 aa  250  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  32.93 
 
 		 623 aa  249  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  32.66 
 
 		 679 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  29.72 
 
 		 621 aa  248  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.09 
 
 		 613 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  34.45 
 
 		 678 aa  248  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  36.81 
 
 		 645 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  32.81 
 
 		 600 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  36.76 
 
 		 640 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  37.04 
 
 		 616 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  35.05 
 
 		 607 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  29.3 
 
 		 652 aa  244  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  31.29 
 
 		 614 aa  244  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  31.48 
 
 		 663 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  39.39 
 
 		 675 aa  243  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  37.32 
 
 		 594 aa  243  9e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.35 
 
 		 675 aa  243  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  32.43 
 
 		 660 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  32.68 
 
 		 660 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  37.9 
 
 		 591 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  32.43 
 
 		 660 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  34.3 
 
 		 647 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  31.08 
 
 		 651 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  32.19 
 
 		 660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  31.56 
 
 		 677 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>