77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2422 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  866    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  30.36 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  34.46 
 
 
416 aa  166  9e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  29.62 
 
 
431 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  25.55 
 
 
429 aa  61.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  30.6 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  30.69 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  26.92 
 
 
355 aa  57  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  31.31 
 
 
339 aa  56.6  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  38.96 
 
 
573 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  26.43 
 
 
349 aa  53.9  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  28.57 
 
 
369 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  28.16 
 
 
344 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  45.83 
 
 
623 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  30.56 
 
 
565 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  26.17 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  34.52 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  43.14 
 
 
496 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  22.9 
 
 
465 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  30 
 
 
527 aa  50.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  28.33 
 
 
565 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  19.37 
 
 
653 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  22.3 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.45 
 
 
579 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  27.14 
 
 
680 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  25.93 
 
 
597 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  27.93 
 
 
353 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  21.17 
 
 
465 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  30.34 
 
 
586 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.71 
 
 
626 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  30.85 
 
 
353 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  36.36 
 
 
626 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  26.12 
 
 
497 aa  47  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  28.57 
 
 
333 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  33.02 
 
 
595 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  32.1 
 
 
513 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  25.61 
 
 
378 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  23.4 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  30.51 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  22.55 
 
 
459 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  27.78 
 
 
251 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  25.58 
 
 
374 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 
647 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  29.29 
 
 
572 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  25.93 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  22.52 
 
 
466 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  24.83 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  37.25 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  25.93 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  32.18 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  36.36 
 
 
695 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  51.28 
 
 
256 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  40 
 
 
457 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  32.32 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  21.5 
 
 
457 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  31.52 
 
 
530 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  21.15 
 
 
464 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  29.27 
 
 
435 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  28.57 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  34.04 
 
 
399 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  30.77 
 
 
516 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  34.62 
 
 
395 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  44.44 
 
 
440 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  30.67 
 
 
666 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  29.41 
 
 
584 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  34.04 
 
 
399 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  28.77 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  30.53 
 
 
450 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  32.69 
 
 
452 aa  43.5  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  29.66 
 
 
634 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  35.56 
 
 
448 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  27.4 
 
 
556 aa  43.5  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  33.96 
 
 
440 aa  43.1  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  20.35 
 
 
451 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  27.62 
 
 
224 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>