More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2942 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  39.15 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.79 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.33 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  37.13 
 
 		 246 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 248 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.46 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.03 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 276 aa  92.8  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.73 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  21.54 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  30.69 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.94 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  24.02 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  27.92 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.72 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  40.68 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.27 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  23.9 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  45.12 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  39.78 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  22.9 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  41.98 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  39.29 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  38.2 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  45.12 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  26.58 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  23.43 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0509  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.12 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.591495 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>