More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6108 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 796 aa  1613    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1049  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 788 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1152  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 790 aa  332  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0878  outer membrane receptor PRHA signal peptide protein  26.48 
 
 		 770 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68825  normal  0.0178454 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 815 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 828 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 817 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3440  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 827 aa  234  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.411786  hitchhiker  0.000375138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 825 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 825 aa  230  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 860 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.81 
 
 		 801 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 829 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.09 
 
 		 806 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.17 
 
 		 797 aa  221  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 828 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 862 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 802 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4653  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 836 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 726 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 799 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 799 aa  214  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 778 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 797 aa  213  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 828 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 810 aa  211  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 850 aa  210  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 726 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 829 aa  209  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 828 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 810 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 797 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 745 aa  206  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 815 aa  204  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 817 aa  204  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 821 aa  204  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 819 aa  204  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 769 aa  204  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 837 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 715 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 718 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 711 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 877 aa  196  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 717 aa  196  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 810 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 734 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 717 aa  194  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 806 aa  195  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  26.01 
 
 		 799 aa  194  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 810 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 709 aa  193  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 719 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.32 
 
 		 709 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.49 
 
 		 689 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  28.62 
 
 		 741 aa  191  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 708 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 703 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 824 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.46 
 
 		 708 aa  190  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 794 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.07 
 
 		 703 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 708 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 715 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  25.37 
 
 		 808 aa  189  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 701 aa  188  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 843 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 741 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 736 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 736 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 752 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  26.93 
 
 		 728 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 730 aa  185  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  26.73 
 
 		 753 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  26.73 
 
 		 753 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 826 aa  184  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  25.99 
 
 		 715 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 771 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  24.9 
 
 		 716 aa  184  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.53 
 
 		 833 aa  184  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 753 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 738 aa  184  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 737 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 820 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 710 aa  183  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 771 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 713 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 812 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 750 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.54 
 
 		 703 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 789 aa  181  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 723 aa  181  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 822 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 689 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 863 aa  178  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 754 aa  179  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 665 aa  179  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 745 aa  178  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 800 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  27.16 
 
 		 716 aa  177  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>