More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3740 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  100 
 
 		 389 aa  792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  99.49 
 
 		 389 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  100 
 
 		 389 aa  792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  59.47 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  57.29 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  59.84 
 
 		 391 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  58.92 
 
 		 382 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  58.92 
 
 		 382 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  56.71 
 
 		 382 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  51.42 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  48.42 
 
 		 381 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  49.46 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  49.46 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  49.46 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  49.46 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  49.46 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  49.46 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  49.46 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  49.19 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  46.06 
 
 		 383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.97 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.45 
 
 		 385 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  47.43 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  47.43 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  47.43 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  47.43 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  47.15 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  45.72 
 
 		 383 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  45.48 
 
 		 383 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  48.24 
 
 		 384 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  46.06 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  45.18 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  45.48 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  44.81 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  44.48 
 
 		 386 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  44.78 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  44.68 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  46.92 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  44.65 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  42.82 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  42.55 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  42.55 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  43.72 
 
 		 381 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  43.17 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  44.47 
 
 		 381 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  44.16 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.92 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  43.22 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  42.75 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  44.33 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  42.97 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  40.79 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.11 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  44.15 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.86 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  43.24 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  42.93 
 
 		 379 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.67 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  42.67 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.67 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  42.05 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.67 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  41.34 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  41.83 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.3 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  41.15 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  42.27 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  40.9 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.31 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  42.75 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  42.38 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  42.38 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  40.9 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.01 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  42.12 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  42.33 
 
 		 384 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.04 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  42 
 
 		 383 aa  258  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  40.37 
 
 		 385 aa  259  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.46 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  42.66 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.21 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  44.09 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  42.07 
 
 		 366 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  42.78 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  41.36 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  42.78 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  39.9 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  41.36 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  41.36 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  42.93 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  42.52 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  42.19 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  42.22 
 
 		 386 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  42.26 
 
 		 380 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  41.15 
 
 		 383 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  40.94 
 
 		 471 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  41.27 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  42.26 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  39.9 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>