More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2144 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 327 aa  618  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  46.13 
 
 		 302 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  46.48 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  42.51 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  40.65 
 
 		 301 aa  199  7.999999999999999e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  39.8 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  47.23 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  39.19 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  41.36 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  36.27 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  45.04 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  43.53 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  40.78 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  43.16 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  41.61 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  38.06 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  38.35 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  35.61 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  41.8 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  35.61 
 
 		 289 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  41.22 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  43.71 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  39.19 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  34.47 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  44.68 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  39.48 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  36.9 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  37.88 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  39.11 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  35.82 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  36.08 
 
 		 290 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  39.7 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  36.33 
 
 		 294 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.05 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  39.49 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  35.96 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  37.36 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  35.53 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  34.56 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  34.47 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  41.81 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  37.45 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 290 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  38.03 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  35.96 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  34.19 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  36.7 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  36.33 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  35.36 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>