More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0006 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  100 
 
 
362 aa  704    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  29.7 
 
 
358 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  30.75 
 
 
404 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  31 
 
 
368 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  31 
 
 
368 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  30.03 
 
 
369 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  29.7 
 
 
358 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  30.84 
 
 
368 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  30.84 
 
 
368 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  30.84 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  29.94 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  30.84 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  29.75 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  30.22 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  29.07 
 
 
353 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  28.24 
 
 
359 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  29.85 
 
 
394 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  30 
 
 
406 aa  142  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  29.09 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  27.49 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  30.63 
 
 
389 aa  135  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  26.65 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  29.83 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  27.48 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  27.71 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  27.48 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  27.48 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  27.71 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  27.71 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  28.88 
 
 
372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  27.48 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  27.48 
 
 
344 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  28.66 
 
 
345 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  26.71 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  27.15 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  26.2 
 
 
361 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  27.2 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  25.68 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  29.77 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  26.91 
 
 
344 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  26.91 
 
 
344 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  26.91 
 
 
344 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  26.91 
 
 
344 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  26.91 
 
 
344 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  27.12 
 
 
390 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  27.44 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  26.91 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  29.21 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  26.91 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  25.21 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  26.63 
 
 
344 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.37 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  25.67 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  32.17 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  25.67 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.37 
 
 
349 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.37 
 
 
349 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.37 
 
 
349 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  32.17 
 
 
432 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.37 
 
 
349 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.37 
 
 
349 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  26.83 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  25.37 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  31 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  31 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  30.86 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  26.12 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  26.52 
 
 
349 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  26.52 
 
 
349 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  26.89 
 
 
360 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  26.52 
 
 
349 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  32.41 
 
 
349 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  25 
 
 
434 aa  110  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  27.35 
 
 
393 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  26.79 
 
 
339 aa  106  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  28.78 
 
 
338 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  26.88 
 
 
388 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  24.93 
 
 
385 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  25.4 
 
 
347 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  26.88 
 
 
406 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  24.93 
 
 
663 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  22.75 
 
 
359 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  22.25 
 
 
679 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  23.74 
 
 
405 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  25.14 
 
 
370 aa  102  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3619  hypothetical protein  27.95 
 
 
347 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542852  normal  0.0156067 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  22.59 
 
 
359 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1228  hypothetical protein  26.2 
 
 
338 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  22.28 
 
 
668 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3864  hypothetical protein  25.16 
 
 
356 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285096  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  23.64 
 
 
359 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2449  hypothetical protein  27.3 
 
 
338 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00490145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  22.65 
 
 
394 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  27.03 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  28.69 
 
 
376 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  24.39 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  25.71 
 
 
821 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  28.49 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  24.39 
 
 
650 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>