144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0375 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
568 aa  1156    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  53.51 
 
 
570 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  52.58 
 
 
563 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  51.24 
 
 
564 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  47.66 
 
 
574 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.25 
 
 
593 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.06 
 
 
563 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.2 
 
 
566 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.98 
 
 
582 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.51 
 
 
592 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  36.91 
 
 
578 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  33.64 
 
 
562 aa  301  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.64 
 
 
562 aa  301  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.54 
 
 
580 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  34.45 
 
 
562 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.77 
 
 
562 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  34.77 
 
 
562 aa  295  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  35.5 
 
 
578 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  35.62 
 
 
584 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.51 
 
 
574 aa  287  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.63 
 
 
584 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  35.78 
 
 
588 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  34.28 
 
 
561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.91 
 
 
595 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  33.75 
 
 
570 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.66 
 
 
585 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.34 
 
 
594 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.93 
 
 
586 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  34.76 
 
 
572 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.12 
 
 
593 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  34.68 
 
 
585 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  35.26 
 
 
586 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  34.68 
 
 
568 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  35.26 
 
 
586 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  34.49 
 
 
585 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  32.83 
 
 
590 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  32.45 
 
 
590 aa  257  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  33.21 
 
 
584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.21 
 
 
581 aa  253  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.31 
 
 
581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  30.97 
 
 
581 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  30.32 
 
 
556 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.28 
 
 
587 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  27.24 
 
 
550 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.6 
 
 
549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  27.31 
 
 
539 aa  183  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  25 
 
 
566 aa  182  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.62 
 
 
554 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.52 
 
 
585 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.96 
 
 
558 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  25.76 
 
 
590 aa  155  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.4 
 
 
557 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  25.13 
 
 
590 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.19 
 
 
554 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  26.29 
 
 
570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  25.35 
 
 
565 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  25.27 
 
 
562 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  27.75 
 
 
562 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  27.75 
 
 
562 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.63 
 
 
560 aa  143  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.46 
 
 
568 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.43 
 
 
573 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  35.9 
 
 
294 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  23.7 
 
 
569 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.48 
 
 
565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  28.67 
 
 
558 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  24.19 
 
 
562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  24.51 
 
 
575 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.46 
 
 
575 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.09 
 
 
608 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.77 
 
 
591 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  25.34 
 
 
602 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  25 
 
 
583 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.97 
 
 
591 aa  104  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.97 
 
 
591 aa  103  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  25.33 
 
 
583 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4055  hemolysin activator protein  39.13 
 
 
180 aa  100  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.18 
 
 
592 aa  99.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.87 
 
 
580 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.16 
 
 
513 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  24.65 
 
 
570 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  25 
 
 
565 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.23 
 
 
560 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.27 
 
 
597 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  22.59 
 
 
582 aa  88.2  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  21.73 
 
 
553 aa  87.8  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.83 
 
 
610 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  45.95 
 
 
121 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  21.59 
 
 
553 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  35.48 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  26.22 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.89 
 
 
590 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.68 
 
 
559 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  23.56 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  21.77 
 
 
547 aa  72  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.6 
 
 
585 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.56 
 
 
583 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.98 
 
 
567 aa  70.1  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  24.4 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.31 
 
 
574 aa  67.8  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>