More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1509 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  55.93 
 
 
796 aa  887    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  55.8 
 
 
796 aa  887    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  60.62 
 
 
827 aa  942    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  99.71 
 
 
679 aa  1383    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  56.27 
 
 
766 aa  770    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  53.06 
 
 
810 aa  821    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
882 aa  1787    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  98.42 
 
 
881 aa  1682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  55.31 
 
 
809 aa  900    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  74.13 
 
 
858 aa  1192    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  98.31 
 
 
881 aa  1679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  57.4 
 
 
796 aa  886    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  92.18 
 
 
742 aa  1361    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  98.31 
 
 
921 aa  1680    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  55.82 
 
 
781 aa  751    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  55.59 
 
 
778 aa  752    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  46.68 
 
 
707 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  98.42 
 
 
881 aa  1682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  62.73 
 
 
821 aa  1001    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  74.26 
 
 
855 aa  1193    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  73.51 
 
 
863 aa  1203    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  58.23 
 
 
795 aa  870    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  56.05 
 
 
796 aa  900    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  74.26 
 
 
855 aa  1193    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  98.31 
 
 
921 aa  1680    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  57.87 
 
 
795 aa  870    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  45.73 
 
 
721 aa  626  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  47.46 
 
 
719 aa  609  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  45.13 
 
 
714 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  45.13 
 
 
714 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  45.76 
 
 
677 aa  605  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  46.35 
 
 
708 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  43.39 
 
 
724 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  42.82 
 
 
713 aa  562  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  42.68 
 
 
713 aa  561  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  43.57 
 
 
709 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  43.54 
 
 
713 aa  549  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  43.62 
 
 
726 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  39.28 
 
 
705 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.72 
 
 
706 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 
725 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  41.04 
 
 
722 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  41.18 
 
 
731 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  42.02 
 
 
722 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  42.02 
 
 
722 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  41.24 
 
 
725 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  37.71 
 
 
793 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  42.02 
 
 
582 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 
706 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 
701 aa  278  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 
712 aa  276  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  32.93 
 
 
689 aa  273  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 
710 aa  272  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 
736 aa  270  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 
714 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 
732 aa  270  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 
722 aa  269  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 
708 aa  269  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 
692 aa  263  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  32.02 
 
 
708 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  33.8 
 
 
703 aa  261  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  31.4 
 
 
703 aa  261  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
701 aa  260  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 
828 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 
709 aa  257  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.59 
 
 
711 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 
701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
702 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
702 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
757 aa  254  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 
701 aa  254  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
734 aa  253  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 
701 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 
710 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 
741 aa  247  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 
701 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 
701 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 
722 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.75 
 
 
696 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 
696 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 
723 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 
815 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
724 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
710 aa  240  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 
703 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 
715 aa  238  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 
724 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
743 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 
708 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
711 aa  237  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 
825 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 
738 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 
825 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.1 
 
 
709 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 
726 aa  234  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 
850 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 
817 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 
726 aa  231  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.94 
 
 
703 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 
715 aa  229  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>