70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2415 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 270 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  97.78 
 
 		 270 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  97.78 
 
 		 270 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  96.93 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  96.93 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  84.19 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  40.7 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  33.8 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  34.72 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  32.62 
 
 		 366 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  29.92 
 
 		 338 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  28.15 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  25.96 
 
 		 359 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  28.57 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.2 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  28.51 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  25.82 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  30.58 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  25.1 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  35.71 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  28.64 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  27.31 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  28.18 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  27.38 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  29.09 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  28.64 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  28.64 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  26.18 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  27.27 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  29.09 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 335 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  30.67 
 
 		 352 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  29.86 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  32.12 
 
 		 349 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  26.2 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  28.89 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  25.93 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  25.96 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  29.1 
 
 		 147 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  28.39 
 
 		 356 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  25.98 
 
 		 348 aa  48.9  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  28.34 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.38 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  28.18 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 383 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  28.11 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.38 
 
 		 344 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25.75 
 
 		 389 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  27.71 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  25.23 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  30.77 
 
 		 384 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  24.29 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.07 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.11 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  29.8 
 
 		 334 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26 
 
 		 411 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.34 
 
 		 400 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.79 
 
 		 385 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28 
 
 		 397 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  25.99 
 
 		 370 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  33 
 
 		 378 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>