More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0305 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  94.69 
 
 		 387 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  94.69 
 
 		 358 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  94.69 
 
 		 358 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  100 
 
 		 358 aa  722    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  75.7 
 
 		 358 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  75.98 
 
 		 358 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  75.98 
 
 		 358 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  75.7 
 
 		 358 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  75.42 
 
 		 358 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  75.98 
 
 		 358 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  75.7 
 
 		 358 aa  544  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  69.75 
 
 		 367 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  69.61 
 
 		 361 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  70.44 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  58.72 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  52.09 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  58.72 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  57.14 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  57.14 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  53.03 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  55.03 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  54.73 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  55.59 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  49.59 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  48.93 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  42.62 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  42.61 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  41.45 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  40.52 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  39.82 
 
 		 340 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  41.16 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  44.16 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  38.21 
 
 		 357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  38.21 
 
 		 357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  38.92 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  38.07 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  38.29 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  37.72 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  37.72 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  37.72 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  37.31 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  35.31 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  33.52 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  33.52 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  33.43 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  32.62 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  32.69 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  34.9 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  33.07 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  32.14 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  33.07 
 
 		 386 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  33.33 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  32.18 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  32.18 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  35.77 
 
 		 391 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  33.79 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  33.06 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  33.24 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  33.24 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.43 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  31.7 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  34.1 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  32.28 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  34.4 
 
 		 386 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  37.21 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  30.65 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  31.9 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.81 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  33.15 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  33.15 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.5 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  34.1 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  33.05 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  33.33 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  34.43 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  31.85 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  34.43 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  34.43 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  31.61 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.77 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.67 
 
 		 361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  33.76 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  33.15 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  31.94 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  33.83 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.77 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  31.18 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  31.18 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  31.18 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  31.18 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  32.77 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  31.81 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  31.18 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  30.87 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  32.11 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  33.84 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  32.11 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  32.95 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  31.34 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  34.48 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>