172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0687 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  807    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  99.75 
 
 		 402 aa  804    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  88.03 
 
 		 402 aa  722    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  53.76 
 
 		 396 aa  415  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  48.98 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  49.87 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  46.84 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  44.11 
 
 		 399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  45.84 
 
 		 416 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  32.49 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  33.43 
 
 		 390 aa  196  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  30.85 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  30.37 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  30.37 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  31.49 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  31.23 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  31.29 
 
 		 388 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  32.27 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  33.01 
 
 		 388 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  31.98 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  31.46 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  32.68 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  30.15 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  27.37 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  27.36 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  24.22 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  24.81 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  24.91 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  24.91 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  25.75 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  24.83 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  24.83 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  21.07 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  29.17 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.14 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.32 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.7 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  23.87 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.29 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  23.17 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.85 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  24.69 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  20.56 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.19 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  25.58 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  21.52 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  30.33 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  23.53 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  21.99 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  21.68 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.78 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  24.83 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  22.34 
 
 		 366 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  27.96 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  22.7 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  26.56 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  21.94 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  18.87 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.88 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 498 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  22.57 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  23.08 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.36 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  23.19 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  23.12 
 
 		 230 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  25.48 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 501 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  27.07 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  22.58 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  17.68 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  23.19 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  20.81 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  24.84 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.29 
 
 		 792 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02661  putative permease, YjgP/YjgQ family  25.16 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>