More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3218 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  100 
 
 
850 aa  1713    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  99.12 
 
 
794 aa  1591    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.56 
 
 
880 aa  125  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 
848 aa  97.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  22.17 
 
 
841 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  21.29 
 
 
854 aa  88.2  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.74 
 
 
835 aa  87.4  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  19.71 
 
 
829 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  21.15 
 
 
845 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.53 
 
 
829 aa  84.3  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  22.74 
 
 
847 aa  84.3  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  22.62 
 
 
821 aa  82.8  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.38 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 
871 aa  81.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 
852 aa  80.9  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  18.91 
 
 
857 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1813  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.2 
 
 
416 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0198484  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  21.33 
 
 
834 aa  79.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.27 
 
 
389 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0909  hypothetical protein  20.81 
 
 
813 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  19.06 
 
 
684 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2831  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.87 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0414508  hitchhiker  0.00948545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  20.82 
 
 
836 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  21.2 
 
 
856 aa  77.4  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.6 
 
 
410 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1545  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.59 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0135691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 
878 aa  75.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.98 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.55 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.56 
 
 
850 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  20.16 
 
 
855 aa  74.7  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  20.88 
 
 
842 aa  74.3  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  20.39 
 
 
858 aa  73.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  26.77 
 
 
397 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  26.77 
 
 
397 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  23.36 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  23.79 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  21.29 
 
 
897 aa  70.9  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  21.51 
 
 
836 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  22.07 
 
 
855 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  27 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  22.6 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2397  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  22.5 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  19.55 
 
 
858 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  26.91 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.94 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  19.77 
 
 
862 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
410 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  21.75 
 
 
842 aa  67  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  22.14 
 
 
414 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  19.74 
 
 
841 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  25.59 
 
 
397 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  21.84 
 
 
414 aa  66.6  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.84 
 
 
414 aa  66.6  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.8 
 
 
397 aa  66.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.8 
 
 
397 aa  65.1  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 
452 aa  65.1  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4462  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.39 
 
 
447 aa  65.1  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  20.75 
 
 
858 aa  64.7  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  20.93 
 
 
840 aa  64.7  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.46 
 
 
400 aa  64.3  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  20.97 
 
 
851 aa  64.3  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  20.72 
 
 
855 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 
844 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  25.83 
 
 
397 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.37 
 
 
395 aa  63.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
386 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
838 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  19.81 
 
 
843 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  19.76 
 
 
849 aa  62.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  21.32 
 
 
835 aa  62.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1676  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.36 
 
 
411 aa  62.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  22.57 
 
 
402 aa  62.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  22.92 
 
 
407 aa  62.4  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 
405 aa  61.6  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.98 
 
 
387 aa  62  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  23.11 
 
 
400 aa  62  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  28.78 
 
 
453 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  25.42 
 
 
397 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  22.83 
 
 
397 aa  62  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  26.02 
 
 
380 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  22.48 
 
 
407 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  20.75 
 
 
404 aa  61.6  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  25.2 
 
 
397 aa  61.6  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 
801 aa  61.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 
379 aa  61.2  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2861  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25 
 
 
415 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.304015  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1709  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.57 
 
 
415 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.105135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  20.04 
 
 
863 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  21.99 
 
 
930 aa  61.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 
844 aa  61.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1602  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25 
 
 
415 aa  61.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0219168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  19.34 
 
 
861 aa  60.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  23.18 
 
 
405 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  22.25 
 
 
647 aa  60.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
401 aa  60.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  21.82 
 
 
832 aa  60.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.74 
 
 
434 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>